临床样本关联分析
比较免疫治疗应答者与无应答者血清5-HIAA水平及其与疗效的关系。
收集接受抗PD-1单抗治疗的NSCLC患者血清和粪便,通过ELISA检测5-HIAA,并依据iRECIST标准分组分析疗效。
Enhancing immunotherapy efficacy in NSCLC through the combined use of phenelzine and Akkermansia muciniphila to regulate gut microbial metabolite 5-HIAA
包含临床样本(两个队列)、人源化小鼠模型、细胞系体外实验,并涉及功能验证(CD8+ T细胞清除)和机制验证(RNA-seq、流式)。
临床NSCLC患者队列 人源化小鼠模型(FMT) LLC细胞皮下移植瘤模型 B16-F10黑色素瘤模型
血清5-HIAA浓度在免疫治疗无应答者中升高,使用ELISA检测 人源化小鼠经FMT移植患者肠道菌群后,对抗PD-1单抗的反应性 5-HIAA补充降低肿瘤浸润CD8+ T细胞比例及IFN-γ和TNF-α表达 苯乙肼(3 mg/kg)抑制5-HIAA合成并增强CD8+ T细胞功能 AKK补充(109 CFU/天)降低血清5-HIAA并增强抗PD-1疗效
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
比较免疫治疗应答者与无应答者血清5-HIAA水平及其与疗效的关系。
收集接受抗PD-1单抗治疗的NSCLC患者血清和粪便,通过ELISA检测5-HIAA,并依据iRECIST标准分组分析疗效。
验证无应答者肠道菌群是否导致血清5-HIAA升高和免疫治疗抵抗。
采集患者新鲜粪便,制备菌液,经抗生素处理后灌胃给小鼠,再接种LLC细胞并给予抗PD-1单抗治疗,监测肿瘤生长和5-HIAA水平及免疫细胞。
直接验证5-HIAA对CD8+ T细胞和免疫治疗疗效的抑制作用及CD8+ T细胞依赖性。
对荷瘤小鼠灌胃5-HIAA,联合或不联合抗PD-1单抗治疗,通过流式细胞术检测肿瘤浸润CD8+ T细胞比例和细胞因子,并通过RNA-seq分析分子机制。在BALB/c裸鼠和CD8+ T细胞清除小鼠中重复实验。
评估不同MAO抑制剂对5-HIAA合成和抗肿瘤免疫的影响,并选择最优药物进行组合研究。
比较苯乙肼、异卡波肼和托洛沙酮对荷瘤小鼠肿瘤生长、血清5-HIAA水平、CD8+ T细胞功能和抗PD-1疗效的影响。
通过16S rRNA测序鉴定导致5-HIAA差异的关键菌群,并验证AKK补充对5-HIAA和免疫治疗的影响。
对人和小鼠粪便进行16S rRNA测序,利用LEfSe分析找出关键菌属;通过RT-qPCR验证AKK丰度;对荷瘤小鼠灌胃AKK,检测肿瘤生长、血清5-HIAA和CD8+ T细胞功能。
评估苯乙肼联合AKK是否能进一步抑制5-HIAA并增强抗PD-1疗效,包括在无应答人源化小鼠模型中的效果。
对荷瘤小鼠给予苯乙肼和AKK联合治疗(单独或联合),观察肿瘤生长、5-HIAA水平、CD8+ T细胞浸润和功能;在无应答人源化小鼠中评估联合治疗对免疫治疗敏感性的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Cytiva | SH30022 |
| 胎牛血清 | Excell | FSP500 | |
| 青霉素-链霉素-两性霉素B | Beyotime | C0224 | |
| ELISA | 5-HIAA ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0075 |
| FMT | 细胞筛网(40微米) | Biologix | 15-1040 |
| 甲硝唑 | Meilunbio | MB2200 | |
| 硫酸新霉素 | Meilunbio | MB1716 | |
| 万古霉素盐酸盐 | Meilunbio | MB1260 | |
| 动物实验 | IgG同型对照抗体 | MedChemExpress | HY-P990679 |
| 抗小鼠PD-1单克隆抗体 | MedChemExpress | HY-P99144 | |
| 5-羟基吲哚乙酸 | Sigma | H8876 | |
| 苯乙肼 | MedChemExpress | HY-B1018A | |
| 异卡波肼 | MedChemExpress | HY-13929 | |
| 托洛沙酮 | MedChemExpress | HY-14196 | |
| 抗小鼠CD8α抗体 | Bio X Cell | BE0117 | |
| IgG同型对照 | Bio X Cell | BE0090 | |
| 流式细胞术 | Zombie NIR活力染料试剂盒 | BioLegend | 423105 |
| 牛血清白蛋白封闭液 | Solarbio | SW3015 | |
| CD3抗体 | BioLegend | 100327 | |
| CD8抗体 | BioLegend | 100711 | |
| 胞内染色破膜洗涤缓冲液 | BioLegend | 421002 | |
| IFN-γ抗体 | BioLegend | 505829 | |
| TNF-α抗体 | BioLegend | 506304 | |
| 细菌培养 | 脑心浸液琼脂 | Hopebio | HB8297 |
| 黏蛋白 | Sigma | M1778 | |
| 厌氧产气袋 | Mitsubishi Gas Chemical | -- | |
| 免疫组化 | 免疫组织化学试剂盒 | absin | abs957 |
| 数字病理切片扫描仪 | KonFoong Bioinformation Tech | KF-PRO-005-EX | |
| 粪便DNA提取 | TIANamp粪便DNA提取试剂盒 | Tiangen | DP328 |
| RT-qPCR | SYBR Green实时荧光定量PCR预混液 | Accurate Biology | AG11718 |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 统计分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本分析 | 患者队列的纳入标准、5-HIAA检测时间点、分组标准(iRECIST) 阅读提示:Clinical samples 部分 |
| FMT人源化小鼠模型 | FMT粪便处理条件(使用30%甘油PBS)、ABX抗生素处理疗程、灌胃频率和剂量 阅读提示:Fecal microbiota transplantation experiment 部分 |
| 5-HIAA给药 | 5-HIAA剂量(2 mg/只/天)、给药途径(灌胃)、起始时间(第3天) 阅读提示:In vivo experiments 部分,图2A、图2B |
| MAO抑制剂处理 | 苯乙肼剂量(3 mg/kg)、给药途径(腹腔注射)、溶剂(0.9%盐水)、给药时间(第3天起每日) 阅读提示:In vivo experiments 部分,图3C、图3D |
| AKK补充 | AKK菌株(ATCC BAA-835)、培养条件、给药剂量(109 CFU/天)、给药途径(灌胃) 阅读提示:Bacterial culture 和 In vivo experiments 部分 |
| 抗PD-1治疗 | 抗PD-1单抗剂量(100 μg/只)、给药时间(接种后第7天开始)、给药方式(注射) 阅读提示:In vivo experiments 部分 |
| 流式检测 | CD8+ T细胞检测时间点、肿瘤组织处理方式、抗体克隆号和染色步骤 阅读提示:Flow cytometry analysis 部分 |