动物模型与治疗
建立早期干预模型,评估长期抗Aβ治疗的剂量效应。
使用APP-SAA KI小鼠,从4.5月龄开始每周腹腔注射不同剂量抗Aβ抗体或同型对照,持续16周。
Early intervention anti-Aβ immunotherapy attenuates microglial activation without inducing exhaustion at residual plaques
包含体外细胞实验、动物模型(APP-SAA KI小鼠)及多组学分析(RNA-seq、蛋白质组、脂质组),并进行功能验证(PET成像)和机制探讨。
APP-SAA KI小鼠 原代小胶质细胞(CD11b+分选)
小鼠模型为APP-SAA KI,含hTfR KI,背景为C57BL/6J。 治疗从4.5月龄开始,每周腹腔注射抗Aβ抗体(Aducanumab)或同型对照(4D5),持续16周。 抗Aβ剂量为1、3、10 mg/kg,同型对照为1或10 mg/kg。 终点分析包括FBB-PET、FDG-PET、脑组织免疫荧光、CSF蛋白质组、RNA-seq等。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立早期干预模型,评估长期抗Aβ治疗的剂量效应。
使用APP-SAA KI小鼠,从4.5月龄开始每周腹腔注射不同剂量抗Aβ抗体或同型对照,持续16周。
量化抗Aβ治疗对淀粉样斑块沉积和组成的影响。
通过FBB-PET、免疫荧光染色(Thiazine、Aβ抗体3552)、ELISA和Western blot检测脑内Aβ水平和斑块形态。
检测慢性抗Aβ治疗是否加剧微出血。
使用普鲁士蓝染色检测脑内含铁血黄素沉积,比较治疗组与对照组。
鉴定抗Aβ治疗相关的CSF生物标志物变化。
对终末CSF进行LC-MS/MS蛋白质组学分析,比较治疗组与对照组。
评估抗Aβ治疗对全脑小胶质细胞基因表达的影响。
MACS分选CD11b+小胶质细胞,进行批量3'RNA-seq,分析DAM、稳态和炎症相关基因表达。
检测小胶质细胞脂质组成的变化。
对分选的小胶质细胞进行脂质提取和LC-MS分析。
验证小胶质细胞糖酵解活性的变化。
在8月龄小鼠进行FDG-PET,测量脑区葡萄糖摄取。
评估残余斑块周围小胶质细胞的激活状态和抗原呈递表型。
使用免疫荧光共染(Iba1、Trem2、Cd68、MHC-II、Galectin-3),并进行3D重建和距离分析。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 阿杜卡努单抗 | -- | -- |
| 同型对照抗体4D5 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 汉克斯平衡盐溶液 | Gibco | 14025092 |
| HEPES缓冲液 | Gibco | 15630080 | |
| 谷氨酰胺补充剂 | Gibco | 35050061 | |
| 免疫荧光 | 噻嗪红 | Morphisto | 12990.001 |
| 甲氧基-X04 | Tocris | 4920 | |
| DAPI | -- | -- | |
| ProLong Gold防淬灭剂 | Thermo Fisher | P36980 | |
| Fluoromount-G封片剂 | Thermo Fisher | 00-4958-02 | |
| 抗Aβ一抗(3552) | See ref [58] | n/a | |
| 抗IBA1一抗 | Wako | 019-19741 | |
| 抗IBA1一抗 | Synaptic Systems | 234 308 | |
| 抗APOE一抗 | See ref [59] | n/a | |
| 抗LAMP1一抗 | Biolegend | 121,602 | |
| 抗GFAP一抗 | Agilent | GA52461-2 | |
| 抗TREM2一抗 | R&D Systems | AF1729 | |
| 抗CD68一抗 | Biolegend | 1,370,002 | |
| 抗MHC II类一抗 | Thermo Fisher Scientific | 14-5321-82 | |
| 抗半乳糖凝集素3一抗 | Cell Signaling Technology | AF1197 | |
| 抗PU.1一抗 | Cell Signaling Technology | 2258 | |
| 抗层粘连蛋白一抗 | Sigma | L9393 | |
| 抗P2RY12一抗 | Anaspec | AS-55,043 A | |
| 二抗 驴抗兔 Alexa Fluor Plus 488 | Invitrogen | A32790 | |
| 二抗 驴抗鼠 Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A32787 | |
| 二抗 驴抗大鼠 Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A32795 | |
| 二抗 驴抗山羊 Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A32849 | |
| 二抗 驴抗绵羊 Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A21448 | |
| 二抗 驴抗豚鼠 Alexa Fluor Plus 647 | Invitrogen | A21450 | |
| 普鲁士蓝染色 | 核固红溶液 | Morphisto | 10264.00500 |
| VectaMount Express封片剂 | Vector Labs | VEC-H-5700 | |
| 蛋白质提取 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | P8340 |
| 组织匀浆管 | Precellys | P000918-LYSK0-A | |
| 蛋白质定量 | Pierce BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Scientific | 23225 |
| ELISA | V-PLEX Plus Aβ多肽检测试剂盒 | Meso Scale Discovery | K15200G |
| U-PLEX小鼠IP-10检测试剂盒 | Meso Scale Discovery | K152UFK | |
| MSD-gold链霉亲和素包被96孔板 | Meso Scale Discovery | L15SA-1 | |
| MSD读板缓冲液T | Meso Scale Discovery | R92TC-1 | |
| Western blot | Laemmli缓冲液 | Biorad | 1610747 |
| Novex WedgeWell 10-20% Tris-Tricine凝胶 | Thermo Fisher | EC66255 | |
| I-Block蛋白封闭试剂 | Applied Biosystems | T2015 | |
| Pierce ECL Western blot底物 | Thermo Scientific | 32106 | |
| Fujifilm医用X射线胶片Super RX-N | Fujifilm | 47410 | |
| 抗Aβ一抗(2D8) | -- | -- | |
| 抗TREM2一抗(5F4) | In-house | -- | |
| 抗APP一抗(Y188) | Abcam | ab32136 | |
| 二抗 山羊抗大鼠IgG HRP | Biorad | 5204-2504 | |
| 二抗 山羊抗兔IgG HRP | Biorad | 5196-2504 | |
| MACS细胞分选 | 神经组织解离试剂盒 | Miltenyi | 130-092-628 |
| 茴香霉素 | Cell Signaling Technology | 2222 | |
| gentleMACS C管 | Miltenyi | 130-096-334 | |
| 40μm细胞筛网 | Corning | 352340 | |
| 无脂肪酸BSA | Sigma-Aldrich | A8806 | |
| Cd11b+磁珠 | Miltenyi | 130-093-634 | |
| MS分选柱 | Miltenyi | 130-042-201 | |
| 质谱样品制备 | 二硫苏糖醇 | Biozol | -- |
| Sera-Mag SpeedBeads磁珠 | GE Healthcare | -- | |
| 赖氨酰内肽酶 | Promega | -- | |
| 胰蛋白酶 | Promega | -- | |
| 质谱分析 | nanoElute纳升高效液相色谱系统 | Bruker | -- |
| C18分析柱 | Dr. Maisch GmbH | -- | |
| timsTOF Pro质谱仪 | Bruker | -- | |
| RNA提取 | RNeasy Plus Micro试剂盒 | Qiagen | 74034 |
| RNA文库制备 | Lexogen QuantSeq 3' mRNA-seq文库制备试剂盒 | Lexogen | 193.384 |
| RNA文库质检 | TapeStation D1000 ScreenTape | Agilent | 5067-5582 |
| RNA测序 | Illumina NovaSeq X 10B测序芯片 | Illumina | -- |
| 脂质提取 | 内标 | -- | -- |
| 脂质分析 | Agilent Infinity II 1290超高效液相色谱 | Agilent | -- |
| QTRAP 6500+质谱仪 | ABSciex | -- | |
| UPLC BEH C18色谱柱 | Waters | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与治疗 | 小鼠品系(APP-SAA KI,含hTfR KI)、年龄(起始4.5月龄)、性别(雌雄兼用)、给药剂量(1、3、10 mg/kg)、给药频率(每周一次)、给药途径(腹腔注射)、疗程(16周) 阅读提示:Methods: Mice, 抗Aβ治疗 |
| 斑块负荷评估 | FBB-PET扫描时间(8月龄)、免疫荧光染色标记物(Thiazine、Aβ抗体3552)、ELISA检测的Aβ亚型(Aβ38/40/42) 阅读提示:Results: 图1, Methods: 免疫荧光、ELISA |
| CSF蛋白质组学 | CSF收集方法、LC-MS/MS分析参数(diaPASEF)、蛋白质鉴定和定量方法(DIA-NN) 阅读提示:Methods: CSF收集、LC-MS/MS |
| 小胶质细胞转录组 | 细胞分选方法(CD11b+ MACS)、RNA提取和文库制备(QuantSeq)、测序平台(NovaSeq X 10B)、差异分析模型(limma/voom,考虑性别和批次) 阅读提示:Methods: RNA提取与文库制备、RNA-seq数据分析 |
| 残余斑块周围小胶质细胞表型 | 脑切片厚度(50μm)、染色标记物(Iba1、Trem2、Cd68、MHC-II、Galectin-3)、共聚焦成像参数(63x油镜)、3D分析(PU.1+核距离) 阅读提示:Methods: 免疫荧光、显微成像、3D评估 |