验证Dicer在血小板中的表达和新合成
确认Dicer在静息血小板中存在,并评估凝血酶刺激诱导的新合成。
采用Western blot、流式细胞术、免疫荧光、液相色谱-串联质谱检测Dicer蛋白;使用35S-甲硫氨酸掺入和蛋白质合成抑制剂(嘌呤霉素、环己酰亚胺)验证新合成;检测mTOR和Mnk1磷酸化。
Dicer Neosynthesis Regulates Platelet Reactivity: A Mechanism Altered in Type 2 Diabetes
包含体外血小板实验、体内小鼠模型、Dicer缺陷小鼠验证、功能实验(cAMP、VASP、肺栓塞)及蛋白组学分析,满足两个以上独立证据层级并含功能验证。
人血小板(健康对照和T2DM患者) 小鼠血小板(野生型、Dicer1缺陷和糖尿病模型) 小鼠肺血栓栓塞模型 小鼠巨核细胞(转染实验)
血小板超纯化(CD45+ <0.005%) 凝血酶刺激浓度(0.1 U/mL)和时间点(0-240分钟) 蛋白质合成抑制剂(嘌呤霉素和环己酰亚胺)的使用 体内凝血酶注射剂量(500 U/kg)和采血时间(60分钟) ADP诱导肺栓塞模型中2MeSADP和肾上腺素的剂量
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认Dicer在静息血小板中存在,并评估凝血酶刺激诱导的新合成。
采用Western blot、流式细胞术、免疫荧光、液相色谱-串联质谱检测Dicer蛋白;使用35S-甲硫氨酸掺入和蛋白质合成抑制剂(嘌呤霉素、环己酰亚胺)验证新合成;检测mTOR和Mnk1磷酸化。
确定Dicer新合成是否导致pre-miR-223向成熟miR-223-3p的转化。
通过实时PCR定量血小板内和上清中的pre-miR-223和成熟miR-223-3p;体外Dicer活性实验使用免疫沉淀去除Dicer验证其必要性;使用miR-451a作为Dicer非依赖性对照。
验证Dicer新合成导致的miR-223成熟是否下调P2RY12 mRNA和P2Y12蛋白。
实时PCR检测P2RY12 mRNA,Western blot检测P2Y12蛋白;相关性分析;排除凝血酶直接切割P2Y12。
评估P2Y12下调是否影响其介导的信号传导功能。
测量cAMP水平和VASP磷酸化;使用嘌呤霉素抑制蛋白合成以逆转效应。
确认体外发现的机制在体内是否发生,并依赖Dicer。
给小鼠静脉注射亚致死剂量凝血酶,检测血小板Dicer、miR-223-3p、P2RY12 mRNA和P2Y12蛋白表达;使用Dicer1缺陷小鼠(Dicer1Pf4Δ/Pf4Δ)验证特异性。
检查Dicer新合成介导的P2Y12下调是否减少血小板反应性和血栓形成。
小鼠预注凝血酶或盐水,60分钟后注射2MeSADP和肾上腺素诱导肺栓塞,记录呼吸停止时间,组织学检查肺部。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养和刺激 | M199培养基 | -- | -- |
| 牛凝血酶 | -- | -- | |
| 蛋白质合成抑制 | 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- |
| 腺苷三磷酸双磷酸酶 | -- | -- | |
| Western blot | 抗Dicer1抗体(小鼠单克隆) | Abcam | ab14601 |
| 抗小鼠HRP偶联抗体 | Bio-Rad | 5178-2504 | |
| 抗Dicer1抗体(兔多克隆) | Santa Cruz | sc-136981 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Cell Signaling | 2144 | |
| 抗P2Y12抗体 | Alomone Labs | APR-012 | |
| 抗兔HRP偶联抗体 | Bio-Rad | 5196-2504 | |
| 抗PAR1抗体 | Novus Biologicals | NBP1-71770 | |
| ECL Western印迹底物 | Bio-Rad | -- | |
| 液相色谱-串联质谱 | 纳升液相色谱1200 | -- | -- |
| Q Exactive HF台式质谱仪 | Thermo Fisher? | -- | |
| 蛋白合成检测 | Dicer1特异性ELISA板 | Cloud-Clone Corp | -- |
| 35S-甲硫氨酸 | -- | -- | |
| 信号通路检测 | 磷酸化mTOR抗体 | Cell Signaling | 2971 |
| 磷酸化Mnk1抗体 | Cell Signaling | 2111 | |
| 总mTOR抗体 | Cell Signaling | 2972 | |
| 总Mnk1抗体 | Cell Signaling | 2195 | |
| 实时PCR | Brilliant SYBR Green QPCR预混液 | Stratagene | -- |
| Mx3000P qPCR系统 | Stratagene | -- | |
| microRNA PCR | miRCURY LNA通用RT microRNA PCR系统 | Exiqon | -- |
| UniSp6 RNA | Exiqon | -- | |
| Dicer活性测定 | 蛋白G琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | -- |
| Amicon Ultra-0.5离心过滤器 | Merck? | -- | |
| mirVana microRNA分离试剂盒 | Thermo Fisher? | -- | |
| Superase In | Life Technologies | -- | |
| 动物实验 | 四氧嘧啶一水合物 | Sigma | A7413 |
| 人凝血酶 | Sigma | T6884 | |
| 2-甲硫基腺苷5'-二磷酸 | Santa Cruz | sc-203464 | |
| 柠檬酸钠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 血小板制备与刺激 | 血小板超纯化方法(免疫磁珠分选)和白细胞污染程度(CD45+<0.005%);凝血酶刺激浓度(0.1 U/mL)和时间点;蛋白质合成抑制剂浓度 阅读提示:Methods: Blood Sampling, Platelet Purification, and Preparation |
| 蛋白表达检测 | 抗Dicer1克隆号和稀释度;抗P2Y12克隆号和稀释度;内参抗体选择;是否使用钙蛋白酶抑制剂预孵育 阅读提示:Methods: Protein Expression: Western blotting |
| mRNA和microRNA检测 | 引物序列和PCR条件;内参基因选择(B2M和GAPDH);miR-223定量标准曲线和外参对照(UniSp6) 阅读提示:Methods: mRNA and microRNA Expressions |
| Dicer活性测定 | 免疫沉淀抗体和蛋白量;底物(外源pre-miRNA)用量和反应条件;RNA提取后检测方法 阅读提示:Methods: In Vitro Dicer-Activity Assay |
| 体内实验 | 小鼠品系和年龄(8周);凝血酶注射剂量(500 U/kg)和采血时间(60分钟);糖尿病诱导方法(alloxan剂量)和血糖标准(≥20 mmol/L) 阅读提示:Methods: Animals, Studies in Mice |
| 肺栓塞模型 | 2MeSADP和肾上腺素剂量;呼吸停止时间记录;血小板计数监测;肺部组织学检查方法 阅读提示:Methods: ADP-Triggered Platelet Pulmonary Microembolism |
| 统计方法 | 正态性检验和后续检验选择;多重比较校正方法;样本量 阅读提示:Methods: Statistics |