人胰岛蛋白质溶解度分析
鉴定T2D患者胰岛中蛋白错误折叠的位置和特征
分离T2D和非糖尿病供体人胰岛,用含1% Triton X-100的缓冲液裂解,离心分离可溶与不可溶组分,通过TMT标记LC-MS/MS进行定量蛋白质组学分析,并进行GO和MitoCarta分析。同时Western blot验证选定蛋白。
LONP1 regulation of mitochondrial protein folding provides insight into beta cell failure in type 2 diabetes
包含人胰岛蛋白质组学、小鼠遗传模型(β-Lonp1 KO)、细胞功能实验、机制验证(LONP1-mtHSP70)及体内外功能恢复实验。
人胰岛(T2D供体与非糖尿病对照) β细胞特异性Lonp1敲除小鼠(β-Lonp1 KO) Min6 β细胞系 人β细胞富集假胰岛
人胰岛供体T2D与非糖尿病的样本量(每组n=4)及Triton X-100不溶性组分分离方法 β-Lonp1 KO小鼠的年龄(4、6、10周)和性别分布(雄性和雌性) 使用LONP1抑制剂CDDO(1μM)或LONP1激活剂84-B10(40μM)处理的浓度和时间 假胰岛生成中腺病毒Ad.RIP2.Lonp1S855A的感染复数(MOI=250)及4-OHT(2μM)诱导重组条件 mCAT过表达小鼠品系(strain no. 030712)及抗氧化剂NAC处理剂量(5mM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定T2D患者胰岛中蛋白错误折叠的位置和特征
分离T2D和非糖尿病供体人胰岛,用含1% Triton X-100的缓冲液裂解,离心分离可溶与不可溶组分,通过TMT标记LC-MS/MS进行定量蛋白质组学分析,并进行GO和MitoCarta分析。同时Western blot验证选定蛋白。
验证LONP1缺失对β细胞功能和血糖的影响
通过Ins1Cre小鼠与Lonp1条件性敲除小鼠交配得到β-Lonp1 KO小鼠,检测血糖、葡萄糖耐量、胰岛素分泌、β细胞质量、凋亡和增殖等。
评估LONP1缺失对β细胞线粒体呼吸、结构和蛋白稳态的影响
分离β-Lonp1 KO小鼠胰岛,测定耗氧率(OCR)、ATP水平、线粒体膜电位、Ca2+动态,并通过电子显微镜和免疫荧光检测线粒体形态和蛋白错误折叠。
确定氧化应激是否是LONP1缺乏导致β细胞损伤的主要原因
检测β-Lonp1 KO小鼠胰岛ROS水平和DNA损伤标志物(γH2AX)。在体外使用NAC处理人胰岛和Min6细胞,体内使用mCAT过表达小鼠,评估减轻氧化应激对β细胞功能和线粒体蛋白错误折叠的影响。
阐明LONP1保护β细胞存活是否依赖其蛋白酶活性或伴侣活性
使用假胰岛技术,在β-Lonp1 KO小鼠或人β细胞中过表达蛋白酶失活突变体Lonp1S855A,并给予mtHSP70抑制剂MKT077,检测细胞凋亡和线粒体蛋白错误折叠水平。
评估增强LONP1活性是否能改善人β细胞在糖脂毒性下的存活
在人胰岛或人β细胞假胰岛中,用LONP1激活剂84-B10处理或过表达Lonp1S855A,然后暴露于糖脂毒性(GLT)条件,检测β细胞凋亡和线粒体蛋白错误折叠。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Triton X-100 | -- | -- |
| 蛋白质溶解度分析 | 蛋白酶抑制剂套装III | Calbiochem | -- |
| 磷酸酶抑制剂套装II | Calbiochem | -- | |
| 蛋白质印迹 | LONP1抗体 | Proteintech | 15440-1-AP |
| GRP75 (mtHSP70)抗体 | Proteintech | 14887-1-AP | |
| HSP60抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-13115 | |
| DNAJA3抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-18820 | |
| CLPP抗体 | Proteintech | 15698-1-AP | |
| ACO2抗体 | Abcam | ab110321 | |
| NDUFA10抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc376357 | |
| SDHA抗体 | Abcam | ab14715 | |
| 总OXPHOS啮齿动物抗体混合物 | Abcam | ab110413 | |
| 总OXPHOS人抗体混合物 | Abcam | ab110411 | |
| TOM20抗体 | Cell Signaling Technology | 42406 | |
| VDAC1抗体 | Abcam | ab14734 | |
| 过氧化氢酶抗体 | Athens Research and Technology | 01-05-30000 | |
| 磷酸化γH2AX抗体 | Merck Millipore | 05-636 | |
| FLAG抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| Twinkle抗体 | Proteintech | 13435-1-AP | |
| HMGCS2抗体 | ABclonal | A14244 | |
| TFAM抗体 | Abcam | ab119684 | |
| Vinculin抗体 | Merck Millipore | CP74 | |
| BN-PAGE | 正十二烷基-β-D-麦芽糖苷 | Sigma-Aldrich | -- |
| 毛地黄皂苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 药物处理 | CDDO | Cayman Chemical | -- |
| 衣霉素 | Cayman Chemical | -- | |
| N-乙酰半胱氨酸 | -- | -- | |
| MKT077 | Cayman Chemical | -- | |
| 84-B10 | MedChemExpress | -- | |
| 棕榈酸酯 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 胶原酶P | Sigma-Aldrich | -- |
| Histopaque | Sigma-Aldrich | -- | |
| Hanks平衡盐溶液 | -- | -- | |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 抗生素/抗真菌剂 | Gibco | -- | |
| TrypLE Express酶 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX | Invitrogen | -- |
| Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- | |
| Amaxa核转染仪 | Lonza Bioscience | -- | |
| siRNA SMART pools | Horizon Discovery | -- | |
| 假胰岛生成 | CellCarrier球形体超低附着微孔板 | PerkinElmer | -- |
| 4-羟基他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 小鼠处理 | 他莫昔芬 | Sigma-Aldrich | T5648 |
| 蛋白质组学 | TMT 16-plex试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 高pH反相肽分级试剂盒 | Pierce | 84868 | |
| FASP蛋白消化试剂盒 | Abcam | ab270519 | |
| Orbitrap Fusion质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RSLC Ultimate 3000纳升超高效液相色谱 | Dionex | -- | |
| PepMap RSLC C18色谱柱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ATP检测 | 生物发光检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| 酶活性检测 | 乌头酸酶检测试剂盒 | Cayman Chemical | -- |
| 细胞死亡检测 | 细胞死亡检测ELISAPLUS | Roche | -- |
| Apoptag原位凋亡检测试剂盒 | Merck Millipore | -- | |
| ROS检测 | ROS/超氧化物检测试剂盒 | Abcam | -- |
| RNA/DNA提取 | 血液和组织DNA提取试剂盒 | QIAGEN | -- |
| RNA提取 | MicroElute总RNA提取试剂盒 | Omega Bio-Tek | -- |
| TRIzol试剂 | Invitrogen | -- | |
| RT-qPCR | 高容量cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 通用SYBR Green Supermix | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 蛋白质定量 | Pierce Micro BCA蛋白质定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 蛋白质印迹 | 4-15% Tris-甘氨酸蛋白胶 | Bio-Rad Laboratories | -- |
| 细胞培养 | PicoLab实验室啮齿动物饲料5L0D | LabDiet | -- |
| 动物实验 | Bayer Contour血糖仪 | Bayer | -- |
| 优泌林R(胰岛素) | Eli Lilly and Company | -- | |
| 细胞培养 | PIM(S)培养基 | Prodo Labs | -- |
| PIM(G) | Prodo Labs | -- | |
| 葵花籽油 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 腺病毒制备 | 氯化铯梯度超速离心 | -- | -- |
| Sepharose CL-4B | Cytiva | -- | |
| 钙成像 | Cal-520 AM | Abcam | ab171868 |
| mito-R-GECO1 | Addgene | -- | |
| 线粒体膜电位测量 | 四甲基罗丹明甲酯 | -- | -- |
| FCCP | -- | -- | |
| 组织染色 | Proteostat聚集小体检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | ENZ-51035 |
| DAPI | Molecular Probes | -- | |
| 胰岛素抗体(豚鼠) | Thermo Fisher Scientific | PA1-26938 | |
| 胰岛素抗体(Fitzgerald) | Fitzgerald | 20-IP35 | |
| Ki-67抗体 | Abcam | ab16667 | |
| PDX1抗体 | Abcam | ab47383 | |
| ALDH1A3抗体 | Novus Biologicals | NBP2-15339 | |
| Urocortin 3抗体 | Salk | PBL7218 | |
| C肽抗体 | Developmental Studies Hybridoma Bank | GN-1D4 | |
| Cy2/Cy3/Cy5偶联二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 细胞分选 | 抗NTPDase3抗体 | -- | -- |
| 抗小鼠IgG2a+b微珠 | Miltenyi Biotec | -- | |
| LS分离柱 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 免疫共沉淀 | 磁珠蛋白A/G | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 对照IgG | Proteintech | 30000-0-AP |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人胰岛蛋白质组学 | 人胰岛供体T2D和非糖尿病的样本量(n=4)、Triton X-100不溶性组分分离方法、TMT标记和LC-MS/MS参数 阅读提示:Methods: TMT labelling MS-based quantitative proteomics, Results Fig. 1 |
| β-Lonp1 KO小鼠模型 | 小鼠品系(Lonp1loxP/loxP;Ins1Cre)、年龄(4-10周)、性别、饮食和饲养条件 阅读提示:Methods: Genetically modified mouse lines, Results Fig. 2 |
| 线粒体功能检测 | OCR测量中的葡萄糖浓度(3mM, 20mM)、oligomycin(10μM)和KCN(3mM)处理条件,及ATP测定中的葡萄糖浓度 阅读提示:Methods: Islet respirometry, ATP assay, Results Fig. 3 |
| 氧化应激干预 | NAC处理浓度(5mM)和时间(24小时),mCAT过表达小鼠品系(strain no. 030712),及评估时间点(5周和7周) 阅读提示:Methods: Genetically modified mouse lines, Results Fig. 4 |
| LONP1-mtHSP70功能验证 | 假胰岛培养条件(MOI=250, 7天)、Lonp1S855A突变体过表达、MKT077浓度(1μM)和处理时间(24小时) 阅读提示:Methods: Pseudoislets, Results Fig. 6 |
| 人β细胞糖脂毒性模型 | 人胰岛或假胰岛、GLT条件(25mM glucose + 0.5mM palmitate)、84-B10浓度(40μM)和处理时间(48小时) 阅读提示:Methods: Human islet samples, Pseudoislets, Results Fig. 7 |