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技术资料/正文
ATAC-seq 数据分析标准报告
560 人阅读发布时间：2023-06-26 15:04
ATAC-seq技术，全称为：Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high
throughput sequencing），是 2013 年由斯坦福大学 William J. Greenleaf 和 Howard
Y. Chang 实验室开发的一种用于研究染色质可及性（通常也理解为染色质的开放
性）的方法(Buenrostro, Giresi, Zaba, Chang, & Greenleaf, 2013)。
该方法通过超活化 Tn5 转座酶将序列接头插入到染色质开放区域，然后通
过 DNA 测序数据分析推断染色质各区域的可及性、转录因子结合位点以及核小
体位置。ATAC-seq 可以在全基因组范围快速灵敏地检测染色质可及性。
相比传统方法，ATAC-seq 的结果具有很强的一致性，同时也和基于组蛋白
修饰 marker 的 ChIP-seq 有较高的吻合程度。另外，ATAC-seq 的重复性，比
MNase-seq 和 DNase-seq 的更强，操作起来也更加简单，细胞或组织的需求量较
少，出来的信号更加漂亮。已是目前研究染色质开放性首选的技术方法。