miRNA研究服务案例4:基因芯片筛选发现乙型肝癌血清血浆microRNA生物标志物
肝癌( hepatocellular Carcinoma,HCC)是死亡率仅次于胃癌、食道癌的世界第三大常见恶性肿瘤。目前常用的肝癌诊断方法有影像学和生物标志物法,但是这些诊断方法的灵敏性和准确率都不够,以至于只有约30%的肝癌能被早期诊断出来。寻找灵敏高效的肝癌早期诊断方法对于肝癌的治疗有重大意义。
近日,复旦大学附属中山医院、复旦大学肝癌研究所樊嘉教授领衔的课题组在肝癌早期诊断方面的研究取得新突破。他们从不同人群血浆中筛选到了由7个 microRNA组成的早期肝癌诊断分子标记物,将其整合后建立起诊断模型,可用来成功“区分”健康人、慢性乙肝患者、乙肝肝硬化患者和肝癌患者;对小于2厘米的肝癌,检出率更接近九成。
microRNA在1993年首次被发现。许多研究表明,在肝癌和癌旁正常组织之间存在microRNA表达谱的差异。另外,研究发现在人类血清血浆中存在大量稳定的microRNA。这些现象表明,大家可以寻找肝癌患者血清血浆中高含量的microRNA,以此作为生物标志物进行肝癌的早期诊断。 在本研究课题中,研究人员利用microRNA芯片筛选、RT-PCR验证等方法寻找到7个microRNA的组合,这一组合能对乙型肝癌 (hepatitis B virus related HCC)患者进行早期诊断。相关成果发表在2011年12月的《Journal of Clinical Oncology》上。microRNA生物芯片技术服务由上海伯豪生物技术有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心完成。
科学家们首先使用microRNA芯片对比肝癌患者VS正常人群,肝癌患者VS慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者,肝癌患者VS肝硬化(cirrhosis)患者血清血浆microRNA的表达谱。结果筛选出15个明显差异表达的microRNA。
microRNA芯片聚类结果
随后科学家们利用RT-PCR的方法对这15个microRNA进行验证分析,从中筛选出7个确定差异表达的microRNA。并利用407份样品 的RT-PCR数据建立起了一个多指标的logistic回归分析模型,用以区分肝癌患者和其它对照人群。最后科学家们又利用390份样品对建立好的诊断 模型进行验证。该模型区分肝癌患者和正常人群的正确率能达到94.1%。这项研究成果对于肝癌的早期诊断和治疗有重大意义。
Receiver opera/ng characteris/c (ROC)
曲线分析肝癌患者与正常人群之间该组 microRNA的表达差异,AUC值为0.941。
课题思路
原文出处:
Zhou J, Yu L, Gao X, Hu J, Wang JP, Dai Z, Wang JF, Zhang ZY, Lu SH, Huang XW, Wang Z, Qiu SJ, Wang XY, Yang GH, Sun HC, Tang ZY, Wu Y, Zhu HG, Fan J. Plasma MicroRNA Panel to Diagnose Hepatitis B Virus–Related Hepatocellular Carcinoma. J Clin Oncol. 2011.38.2697. (影响因子18.970)
使用服务种类: Agilent miRNA 芯片服务
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