“富矿”的开发:从miRNA到lncRNA

lncRNA研究相关数据库信息

   2013-10-04
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1). lncRNAdb: 提供有生物学功能的长链非编码RNA的全面注释。这是长链非编码RNA研究领域的著名数据库。

网址:http://www.lncrnadb.org/

2). NONCODE: 提供对长链非编码RNA的全面注释,包括表达和该团队开发的ncFANs计算机软件预测的lncRNA功能。非编码RNA研究的知名数据库。

网址: http://www.noncode.org

3). LNCipedia: 对人类的长链非编码RNA的序列和结构全面的注释。

网址:http://www.lncipedia.org

4). LncRNADisease: 提供了文献报道的疾病相关的长链非编码RNA的注释。

网址: http://cmbi.bjmu.edu.cn/lncrnadisease

5). NRED: 提供人和小鼠的长链非编码RNA在芯片数据的表达信息。

网址:http://jsm-research.imb.uq.edu.au/nred/

6). ChIPBase: 提供长链非编码RNA的表达图谱和转录调控的全面鉴定和注释。整合了高通量的RNA-seq鉴定的lncRNA及其表达图谱和ChIP-Seq实验技术鉴定的转录因子结合位点。

网址:http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/

7) fRNAdb: 收集了包括H-inv,NONCODE 和 RNAdb 三个数据库的注释和未注释的非编码转录本。

网址:http://www.ncrna.org/frnadb/

编辑: hejianxin    来源:丁香园

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