“富矿”的开发:从miRNA到lncRNA

lncRNA高通量研究结果的验证

   2013-10-08
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Northern blot可直接检测目的lncRNA存在与否以及它在不同组织、器官、发育阶段、环境压力以及处理前后或处理过程中的表达模式,是一种经典的手段,实验过程较烦琐。

qRT-PCR是较常用的验证办法。实验过程简便,灵敏度高。可用Taqman探针或SYBR Green法检测多个或单个lncRNA的表达水平。

FISH(Fluorescence in situ hybridization)可用于检测DNA或RNA并对其进行定位。RNA-FISH可对组织切片、细胞涂片等材料中的lncRNA进行定性、定位和相对定量研究,也是一种较常用的lncRNA验证方法。

对多基因大样本进行验证时,可利用Panomics QuantiGene Plex 技术,同时对3-80个lncRNA进行大样本验证。这种技术适合微量样本做多基因检测。实验无需抽提纯化RNA,直接定量来源于培养细胞、全血或组织等样本中的lncRNA,也无需反转录及PCR.

有的lncRNA的表达非常低,可用Panomics ViewRNA原位检测技术进行单个lncRNA的表达水平、分布以及与潜在靶基因表达的相关性研究。该方法便捷灵敏,适合细胞、血液和FFPE样本等。

编辑: hejianxin    来源:丁香园

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