sunnyboy6345
发表于 2004-07-26 22:37
引物设计主要是要注意以下几个事项:
1. 发夹结构;
2. 反向配对;
3. GC含量(40-60%);
4. 退火温度(45-65度);
5. 引物长度(18-27bp);
5. 3' 端最好是C、G(提高结合度);
6. 引物在序列中的错配位点。
大致就这几个方面,重要性依次降低,由其是3' 端绝对不能形成发夹结构。
那么你说你这段能不能设计引物呢?其实设计引物都只是好中选优的问题。
我大致看了一下,以20bp为例,这段序列从第四个碱基开始就可以设计引物。