如何确定microRNA的靶基因

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王老师
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  microRNA(miRNA)是一类非编码的小分子RNA,通过参与基因的转录后水平表达调控,调控机体的多种生理与病理进程。

 

      miRNA antagomir是经过特殊化学修饰的miRNA拮抗剂,通过与体内的成熟miRNA强竞争性结合,阻止miRNA与其靶基因mRNA的互补配对,抑制miRNA发挥作用。与普通抑制剂相比,miRNA antagomir在动物体内外具有更高的稳定性和抑制效果,且能克服体内细胞膜、组织等障碍富集于靶细胞。antagomir在细胞实验中不需要转染试剂,从而避免了转染试剂包装过程的复杂步骤及其对实验的影响。 在动物实验中可用全身或局部注射、吸入、喂药等方法进行给药,作用效果持续时间可长达数周。汉恒生物提供针对miRBase 18.0中人、小鼠、大鼠的miRNA antagomir小规格包装现货,大规格包装需定制,其他物种需要定制。

 

     “封闭海绵(sponges封闭)”是一种miRNA靶基因的竞争性抑制剂,是将若干个miRNA的反义序列串联在一起,连接到合适的载体中表达,其转录物“吸附”相应的miRNA,与miRNA靶基因形成竞争,导致靶基因去抑制化。因此miRNA海绵是研究miRNA功能的重要工具。“封闭海绵”通过特定位点与mRNA的3′UTR区结合来发挥封闭微小RNA的作用。现有研究表明“封闭海绵”作为一种新型的研究miRNA的方法在生物体内、外功能丧失研究中均优于目前的反义寡核苷酸抑制剂和基因敲除方法。随着越来越多非编码RN A的发现,“封闭海绵”在研究其功能上有着不可或缺的作用。

 

       通过筛选好的miRNA,可以进一步对进行功能方面的研究。通常是合成相关模拟物或者构建载体转染细胞,来实现研究目的基因的功能。