收到lewis 1121的质粒,谢谢(内附滤纸质粒溶解提纯保存的方法)
丁香园论坛
非常感谢lewis 1121!!!
另外在论坛中找到部分关于滤纸上质粒溶解提纯保存的方法,贴在这里,供同道参考。(没有进行系统整理,也未按原发贴顺序,详情还请见原文)
请问:如何从滤纸上洗涤下质粒DNA?(dxyshining )
我是这样做的,加入PH8.0 TE,边加边用枪尖压实滤纸,直至确认能吸出一点液体,然后用这液体去做转化.记住要留出点呵.滤纸也不要马上扔掉. (楚风)
4度下TE浸泡过夜,次日即可使用....(roger )
1。滤纸有质粒部分剪下,加入少量纯水,浸泡。
2。高速离心,吸出上清。
3。用离心上清转化感受态细菌。(eeflying)
看质粒浓度,一般可以取十分之一左右的量转化,其余的冻存备用。(yong)
(多长时间可溶于水)质粒是速溶的,有30分钟怎么也够了。(eeflying)
大家好! 我从一位学者那要了一个质粒(在滤纸上),只有1-2微克(我准备先用一半),浓度未知;我做转化需要100ngDNA, 且其体积要求小于10微升(我打算用不超过4微升),这意味着从滤纸上溶解下的质粒浓度应大于是25ng/微升,故只能用小于40微升的纯水来溶解滤纸上的质粒;这连纸都不会湿!更不用说用分光光度计测浓度了。是否应先用稍多点的水溶解,测浓度后,再用乙醇来浓缩吗?滤纸可直接取出吗?(dengjunhui )
用已醇再沉淀,损失一般较大,建议你先电击转化后挑单克隆再提取质粒!(tigertang )
一般来讲,对于从别人那里获得的质粒应该进行以下操作:
【1】溶解质粒:根据质粒的多少,一般终浓度为50ng/ul;
【2】转化:应使用适当的宿主菌,如无特殊说明,使用DH5alpha;感受态的效率一定要高,制备方法可以在论坛内检索;
【3】筛选:涂板时注意抗性,L棒在平板上沿半径缓慢、匀速旋转一周,切忌反复涂;
【4】鉴定:小提质粒,根据图谱进行相应的酶切鉴定,必要时测序;
【5】质粒保存:大量制备已经证实的质粒,检测纯度,用TE溶解分装,同时应使用无水乙醇充分混悬一定量的质粒并分装,-80度保存;
【6】菌种保存:将过夜培养物与等量甘油充分混匀、分装,-80度保存;取适量菌液冻干,-80度保存。(liven)
很有启发,但有两个问题没搞明白:
1:【5】中同时应使用无水乙醇充分混悬一定量的质粒并分装 有何目的?用TE溶解分装-80度保存不就可以了吗?
2: 【6】中取适量菌液冻干,-80度保存。好像分子克隆等书这种方法好像没有提过,能详细解释一下好吗?
另外在用转化液(200ul;)涂布抗生素平板时生长菌落过密,不好挑选单菌落。请教这个问题除了用少量转化液(50ul;)涂布外,可否用画线法分离单菌落? (money )
使用无水乙醇充分混悬一定量的质粒并分装 ,此时质粒在室温可以放置3个月以上。这样做可以认为是质粒的永久保存。冻干菌种置-80度保存可以认为是菌种的永久保存。
涂板时L棒在平板上沿半径缓慢、匀速旋转一周,就像秒针一样,这样菌落密度就逐渐降低。当然了,在转化率非常高的情况下,划线法也可以用。 (liven)
少用点水。多溶一会儿,吸取时拼命挤出一些就够了(除非质粒浓度太低),涂板时你可以涂一部分(1/5~1/3)到平板上,剩下的涂到另一个平板上,不就是两个梯度了吗? (biowind)
1)先用别的质粒验证感受态
2)用尽可能少(但一定要彻底泡湿)的TE浸泡
3)延长热休克后的温浴时间至2hr
4)取一半,离心浓缩,涂板
5)剩下的接种试管,选择培养基液体培养过夜,划线分离单菌落 (Yong)
如不立即使用该怎样保存?
放到合适体积的TE里-70冻起来(hepatitis )
可以直接把滤纸放在-20或-70的冰箱中,或者取一部分溶于TE中保存。个人推荐直接保存不溶解。要注意密封。 (kras)
与其直接保存,还不如赶快把它洗下来,然后转到载体菌中,一是重新提取质粒、鉴定正确后,冻干保存;二是保存转有质粒的细菌,甘油管、冻干管、穿刺管。这样做保险。呵呵!你以为呢? (nothing)
一定要先转化、鉴定,大量提取质粒,质粒和菌种冻存同时进行。质粒用无水乙醇冻存。 (liven)