蛋白相互作用技术

随着不同的基于质谱分析方法的发展，可以研究的蛋白互作网络的范围也在逐渐增加。更重要的是，用于肽和蛋白质定量的新兴方法产生的数据是完整且无偏差的，是研究完整网络或蛋白互作的基本要求。基于数据依赖性采集（Data-dependent acquisition, DDA）易于执行，并能快速评估样本中的物质的数量。除了简单之外，还需要对蛋白质进行鉴定和翻译后修饰。任何蛋白质的生物学特性在动态系统中的已知程度都是极微小的，不断增加 ...

蛋白互作技术蛋白质是生物功能最直接的执行者，虽然一些蛋白质可以独立的完成他的使命，但是大部分的蛋白都是需要一些伴侣分子的协助一起完成任务或者形成复合物之后才能充分发挥他的功能。所以，了解蛋白质与蛋白质之间的相互作用，能够帮助我们更好的了解细胞的生命活性，揭示隐藏在表象下的调控机理。经典的蛋白互作分析研究方法主要包括三个：酵母双杂交、免疫共沉淀、GST-pull down。1. 酵母双杂交技术：主要用来进行互作蛋白的筛选 ...

定性结果可以用肉眼判断。目视标本也无色或近于无色者判为阴性，显色清晰者为阳性。但在 ELISA 中，正常人血清反应后常可出现呈色的本底，此本底的深浅因试剂的组成和实验的条件不同而异，因此实验中必须加测阴性对照。阴性对照的组成应为不含受检物的正常血清或类似物。在用肉眼判断结果时，更宜用显色深于阴性对照作为标本阳性的指标。目视法简捷明了，但颇具主观性。在条件许可下，应该用比色计测定吸光值，这样可以得到客观的数据。先读出标本（ ...

荧光能量共振转移 （FRET）检测活体中生物大分子纳米级距离和纳米级距离变化的有力工具，广泛应用于生物大分子相互作用分析、细胞生理研究、免疫分析等。原理当供体荧光分子的发射光谱与受体荧光分子的吸收光谱重叠，并且两个分子的距离在 10nm 范围以内时，就会发生一种非放射性的能量转移，即 FRET 现象，使得供体的荧光强度比它单独存在时要低的多（荧光猝灭），而受体发射的荧光却大大增强（敏化荧光）。应用1、生物大分子结构和功能研究：细胞膜 ...

tyw5668 请问是不是免疫组化、免疫荧光、Elisa？谢谢lianhongli 应该是酵母双杂、免疫共沉淀和共定位吧。gingivalis 不管答案是什么，千万不要以为这就是权威。方法是无限的。不怕做不到，就怕想不到。summityoung 1.酵母双杂交是初筛2.筛到得蛋白要用Co-IP、GST-Pull down进行验证bioyangyu tyw5668 wrote:请问是不是免疫组化、免疫荧光、Elisa？谢谢应该是楼上几位说的酵母 ...

标题：Protein-Protein Interactions--Methods and Applications内容：研究蛋白质相互作用的各种方法和应用格式：PDF大小：10Mb（最小不要小于500kb）语种：英文简介：2004年的humana press出版的,为目前有关蛋白质相互作用的方法总结下面是该书的目录Protein–Protein Interactions ：Methods and Applications March 2004Part I. ...

随着对多种重要生物的大规模基因组测序工作的完成，基因工程领域又迎来了一个新的时代---功能基因组时代。它的任务就是对基因组中包含的全部基因的功能加以认识。生物体系的运作与蛋白质之间的互作密不可分，例如：DNA合成、基因转录激活、蛋白质翻译、修饰和定位以及信息传导等重要的生物过程均涉及到蛋白质复合体的作用。能够发现和验证在生物体中相互作用的蛋白质与核酸、蛋白质与蛋白质是认识它们生物学功能的第一步。酵母双杂交技术作 ...

清泓生物技术（上海）有限公司1. 稳定高效的蛋白表达平台真核表达系统 –哺乳细胞表达平台，- 有活性的蛋白：哺乳细胞表达平台有效保证目的蛋白正确折叠和正确修饰- 蛋白复合物：多个蛋白共表达，表达和纯化制备蛋白复合体- 哺乳细胞：众多蛋白，尤其是分泌蛋白最理想的宿主细胞- 快速高效：一个月内得到目的蛋白- 最优流程：细胞生长，蛋白表达和纯化工艺流程- （可选）蛋白活性检测服务 真核表达系统 –昆虫细胞表达平台- 有活性的蛋白：昆虫细胞提供较好的蛋白正确折叠和修饰 ...

抗体是机体免疫系统为清除“异己”而产生的保护性免疫球蛋白。抗体能特异性识别并结合于抗原蛋白的抗原决定簇（表位）上，并通过一系列手段达到清除抗原的作用。抗原抗体相互识别作用原理常常应用于各种免疫检测方法中，免疫微阵列技术是其中一种高通量的免疫检测分析技术。其原理十分简单，可类比于ELISA反应原理：在固体支撑材料表面将各种不同的探针（抗原蛋白或多肽）固定成阵列，与待测样品（血清、组织液等）中的抗体相互作用，然后借助标 ...

Large scale nuclear extract preparationHattoti's protocol adapted to cell culture:Hattori M, Tugores A, Veloz L, Karin M, Brenner D (1990) A simplified method for the preparation of transcrip-tionally active liver nuclear extracts. DNA Cell Biol. Vol. 10, P.777�781I. Homogenize cells or t ...

Upstate公司在世界上最先开发出步骤优化简洁的商业化ChIP分析试剂盒，保证实验的准确性和可重复性，同时Upstate提供广泛可行的ChIP级别应用抗体。ChIP基本试剂盒和特定蛋白质ChIP级别应用抗体结合完成一个完整的染色质免疫沉淀分析。在过去的数年中，Upstate提供的ChIP分析试剂盒和ChIP级别应用抗体得到了全世界科学家的认可，文献应用极为广泛。Upstate最新推出EZ Chip™（ cata ...

Author InformationPrimary AuthorChi-Wei Lee ( tom.lee1964@msa.hinet.net ) AffiliationChang Gung University , TaiwanCo-Author(s)Yu-Chin Chen (Graduate Institute of Chemistry, National Sun-Yat Sen University, Taiwan. Email: b8722035@student.nsysu.edu.tw) Prot ...

蛋白质组学 肽类在线 蛋白质组学 哈佛蛋白质组学 生物大分子3D结构/PDB 球蛋白数据库 Protein Structure Database 北大蛋白质数据库 PIR蛋白质序列数据库 中国分布计算之蛋白折叠 Proteome Biokownlege 蛋白质晶体论坛 中科院蛋白质科学研究平台 上海生科院蛋白质组分析中心

本文根据华东理工大学生物工程学院的酶工程课件整理而成一、实验流程二、实验安排 第1次菌体超声破壁、离心、包涵体复性、装离子交换柱 第2次测酶活、定蛋白离子交换层析 层析样品进行浓缩、透析 第3次浓缩、透析前、后样品测活、定蛋白 装分子筛柱 第4次分子筛层析，并对收集样品进行测活、定蛋白等 第5次对分离纯化各样品进行蛋白电泳分析，并绘出分离纯化表三、实验操作 第1次：菌体超声破壁、离心、包涵体复性、装离子交换柱 实验顺序：超声破壁→离心→装离子交换柱→平衡 ...

随着 cDNA 微阵列和寡核苷酸芯片（下文没有特别说明时，统称为 DNA 微阵列）等高通量检测技术的发展，我们可以从全基因组水平定量或定性检测基因转录产物 mRNA 。在本章中，基因表达数据特指基于 DNA 微阵列实验得到的反映 mRNA 丰度的数据，而不包括基因表达最终产物――蛋白质丰度的数据。由于生物体中的细胞种类繁多，同时基因表达具有时空特异性，因此，基因表达数据与基因组数据相比，要更为复杂，数据量更大，数据的增长速度更快。基因表达数据中蕴含着基 ...

用于检测基因表达水平的 DNA 微阵列实验，应用之一是比较实验，目的是比较两个条件下的基因表达差异，从中识别出与条件相关的特异性基因，例如，识别可用于肿瘤分型的特异基因等。为了提高实验的可靠性，对于同一样本，往往有两次或更多次的重复实验，但是，由于 DNA 微阵列的费用仍然很昂贵，不可能重复足够多的次数来满足实验数据分析的要求，因此需要采用统计方法来分析这些数据。对于这些表达数据的分析，目的就是要识别在两个条件下有显著表达差异 ...

对于基因表达谱数据的分析是生物信息学的研究热点和难点。转化为数学问题，分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构，结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题，所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析（ Exploratory Data Analysis ）、描述建模 (descriptive modeling) 、分类、聚类、回归和机器学习等。 基因表达谱分析所采用的常用方法是聚类，其目的就是将 ...

在生物医学中，基于表达数据的肿瘤分型诊断是重要的应用领域。 1999 年， Golub 等人的研究证明了肿瘤亚型之间在基因表达上的差异，通过对一组特异基因的表达检测，可以进行临床诊断，并指导治疗方案的制定。随后，很多研究组开展了用 DNA 微阵列检测基因表达用于肿瘤诊断的研究，所涉及的肿瘤包括白血病、乳腺癌、肺癌、结肠癌等，有些工作已应用于临床实践。在这些研究中，根据表达数据对样本进行肿瘤亚型分类成为生物信息学的一项重要研究内容。分类是 ...

1• 边肇祺，张学工等 .2000 年 . 模式识别（第二版） . 清华大学出版社 . 北京 . 2• 傅京孙 . 1990 . 模式识别应用 . 北京大学出版社 . 北京 . 3• 陆汝钤 . 1996. 人工智能 . 科学出版社 . 北京 . 4• 徐克学 . 1999. 生物数学 . 科学技术出版社 . 5• Alizadeh AA, Eisen MB, Davis RE, Ma C, Lossos IS, Rosenwald A, Boldrick JC, Sabet H, Tran T, Yu X, Powell JI, Yang L, Marti GE, Moore T, Hudson J, Jr., Lu L, Lewis DB, Tibshirani R, Sherlock G, Chan WC, Greiner TC, Weisenburg ...

基因表达存在组织特异性、细胞周期特异性和外界信号的响应特异性等特性，这些特异性都是由细胞内复杂而有序的调控机制实现的。对基因表达调控机制的研究具有非常重要的理论和应用价值，研究的目的是要回答以下问题：在特定的细胞转态下，有哪些基因发生了表达？它们是通过何种方式被调控的？它们的表达量是多少？这些基因的产物对细胞的生理活动会产生什么影响？诸如这些问题的答案将揭示生命奥秘和指导临床实践，例如，可以通过测量基因的表达 ...