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CRISPR-Cas9 全程实操教程:从 gRNA 设计到挑单克隆全程指导
的原件与表达 Cas9 的原件相连接,得到可以同时表达两者的质粒,将其转染细胞,便能够对目的基因进行基因操作,在 PAM (5'-NGG) 上游~3bp 进行切割,如下图所示。因此本实验的关键步骤是设计一对 20bp(不包括 NGG 在内的)完全互补的 oligo 插入到如上图所示的 filler。另 U6 启动子需要 5' 端的 G 起始转录,因此若设计的 oligo 第一个碱基非 G,需额外增加一个 G。操作详细流程1. 设计 sgRNA关于 sgRNA 的设计我们有专门开过一篇文章《一文掌握
继续寻找合适成对 sgRNA 序列。04 根据找到的合适的 sgRNA 订购 oligo图为 U6 真核表达载体设计,Forward oligo:5'-ACGG, Reverse oligo:5'-AAAC。05 关于 cas9 的几个注意事项1)CRISPR-cas9 最主要的要求:PAM 序列为 NGG。2)sgRNA,即 cas9 guide RNA,是引导 cas9 蛋白在基因编辑位点进行定向切割,所以一般是 20 个碱基,不含 PAM 序列。3)设计的 sgRNA 一定有效吗?一般设计
1.常用载体分类:2,常用载体元件介绍:(1) 启动子:启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。启动子主要分为广谱启动子和特异性启动子。广谱启动子为在各种组织、细胞上广泛表达的启动子;特异性启动子为在特异性组织或者细胞类型上表达的启动子。常用广谱启动子有CAG,CMV,EF1a,PGK等,还包含启动RNA的III型启动子U6和H1启动子;常用特异性启动子如成熟神经元特异性启动子hSyn,投射神经元特异性启动
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