土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)

土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)

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  • ¥1300
  • 中科雷鸣
  • 北京
  • MBD06
  • 2025年10月10日
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      常温

    • 保质期

      3年

    • 英文名

      见包装

    • 库存

      5000

    • 供应商

      中科雷鸣(北京)科技有限公司

    • CAS号

      见包装

    • 规格

      100T

    土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法)
    货号:MBD06
    【概述】
    本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和缓冲液系统,可从样品中分离纯化高质量基因组 DNA。经特殊
    包被的磁珠在一定条件下对目的 DNA 具有很强的亲和力,而当条件改变时,磁珠释放吸附的 DNA,能够达
    到快速分离纯化 DNA 的目的。整个过程安全、便捷,提取的 DNA 纯度高。使用本试剂盒纯化的基因组 DNA
    的 OD260/OD280 均在 1.7-2.0 之间,可以应用到 PCR、酶切、杂交等分子生物学实验。
    【适用范围】
    本试剂盒适合花坛土、花盆土、农田土、山林土、淤泥、红土、黑土、粉尘等多类土壤环境样本的提取
    【试剂盒包装及组成】

    【试剂盒包装及组成】

     

     

     

    试剂盒组成

     

     

     

     

     

     

    规格

     

     

     

     

     

     

     

    10T

     

     

    50T

     

     

    100T

     

     

    200T

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    裂解液 S06

     

    6.6 mL×1

     

    33 mL×1

     

     

    66 mL×1

     

    132 mL×1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    裂解液 S2

     

    3.3 mL×1

     

    16.5 mL×1

     

     

    33 mL×1

     

    66 mL×1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    磁珠

     

    0.55 mL×1

     

    1.4 mL×2

     

     

    5.6 mL×1

     

    11 mL×1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    缓冲液 W3

     

    5.5 mL×1

     

    27.5 mL×1

     

     

    55 mL×1

     

    110 mL×1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    漂洗液

    /

     

     

    1(空瓶)

     

     

    1(空瓶)

     

    1(空瓶)

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    洗脱液

     

    4 mL×1

     

    20 mL×1

     

     

    40 mL×1

     

    80 mL×1

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    使用说明书

     

    1 份

     

    1 份

     

     

    1 份

     

    1 份

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    磁铁

     

    1 块

    /

     

    /

     

    /

     


    【储存条件】
     磁珠可以在室温下(15-25℃)运输,但请置于 2-8℃保存。


     其余试剂室温保存,有效期 12 个月,更长时间的保存可置于 2-8℃。缓冲液 W3 若出现混浊或沉淀,请将试
    剂在冰箱或冰水浴中放置至澄清透明后使用。其余试剂 2-8℃保存条件下,若溶液产生沉淀,使用前应


    将试剂盒内的溶液在室温放置一段时间,必要时可在 37℃水浴中预热 10 min 溶解沉淀,摇匀后使用。
    土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法) 1 / 4
    版本 2019/01/15(01)
    【注意事项】
     尽量使用新采取的土壤样本,不同样本在采样前应先查阅相应的最佳保存条件。
     整个裂解过程操作尽量温和,并在要求时间内完成。
     在需要吸取上清液的步骤中应避免吸到沉淀,以免影响产物纯度。

     客户自备材料:氯仿、异丙醇、无水乙醇、药匙、离心管、水浴锅、离心机(最大离心力≥12000 rpm/min
    (~10010×g))。
     请于本实验开始前穿上实验服、佩戴手套及口罩,避免实验操作过程中试剂沾染皮肤、眼睛等,并防止
    吸入口鼻。如不慎发生以上情况,请立即用清水冲洗,必要时请及时就医。

     使用前请预先在漂洗液瓶或离心管中配制 70%乙醇,并提前将水浴锅调至 65℃备用。

     磁珠在使用前一定要充分混匀。磁珠加入后,请尽量减少用枪头吹打混匀,防止磁珠沾在枪头上,造成
    基因组 D A 损失。

    【操作步骤】
    1. 取土壤样本 250 mg 于 2 mL 离心管中,加入 200 μL 洗脱液,涡旋混匀,再加入 600 μL 裂解液
    S06 涡旋振荡至样本混匀后,向离心管中加入 300 μL 裂解液 S2,颠倒混匀。
     本步骤土壤中加入裂解液后,可采用涡旋混匀的方式,使土壤完全处于悬浮状态。后续步骤中不建议再
    采用涡旋混匀的方式,并注意操作尽量温和,以防止基因组 DNA 断裂。

     当样本量大于 250 mg 时,请按比例增大裂解液的体积,否则可能会影响 DNA 的得率及 DNA 溶液的颜色。

    2. 将离心管置于 65℃,水浴 25-30 min,期间颠倒混匀数次。
    3. 室温放置 3-5 min,加入 400 μL 氯仿(请于通风橱或生物安全柜中操作,注意防护),轻柔混匀
    15 s,静置 3 min,12000 rpm(~10010×g)离心 5-10 min。
    4. 取出离心管,小心吸取 700 μL 上清于新的 1.5 mL 离心管中,加入 500 μL 的缓冲液 W3,颠倒混
    匀,12000 rpm(~10010×g)离心 5-10 min。
     吸取上清时,切勿吸取中间层(变性蛋白质等)。

     缓冲液 W3 若出现混浊或沉淀,请将试剂在冰箱或冰水浴中放置至澄清透明,摇匀后使用。
    5. 取出离心管,小心吸取 1mL 上清于新的离心管(2 mL)中,加入等体积异丙醇,颠倒混匀 10
    sec,再向离心管中加入 50 μL 磁珠,振荡混匀 1 min,室温静置 3 min,期间颠倒混匀 2 次。
     吸取上清时,请勿触及沉淀或管底。
     向离心管中加入磁珠之前,请确保磁珠彻底重悬,可在使用前振荡混匀。确保磁珠在结合过程中呈悬浮
    状态。

    6. 将离心管置于磁力架或磁铁上进行磁分离,吸弃废液,从磁力架或磁铁上取下离心管。
    土壤基因组 DNA 提取试剂盒(磁珠法) 2 / 4
    版本 2019/01/15(01)
     若离心管管口及管壁上沾有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管,可参考如下步骤:将离心管置于磁力架
    上,待磁珠完全吸附于管壁后,上下颠倒磁力架,使沾在管口的磁珠重悬至溶液中,避免磁珠损失。
     
     吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。

     从磁力架或磁铁上取下离心管后,若离心管中仍有废液,可再次磁分离,吸弃废液。

     本公司有多功能磁力架(Mag0103),无需使用移液器吸净废液,直接倾斜磁力架将废液倒出即可,可
    根据需要购买。

    7. 向离心管中加入 600 μL 漂洗液(使用前请预先配制 70%乙醇),轻柔混匀 1-2 min,将离心管置
    于磁力架或磁铁上进行磁分离,吸弃废液。
     若离心管管口及管壁上粘有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管。
     吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。
    8. 重复步骤 7 一次。
     若离心管管口及管壁上粘有少量磁珠,请将磁珠重悬至离心管。

     吸弃废液时,尽量吸净管盖及管底残液,请勿吸入磁珠。

     为缩短后续晾干时间,可将离心管 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再置于磁力架或磁铁上进行磁分
    离,再次吸弃废液。

    9. 室温开盖晾干 5-10 min(可将离心管开盖置于超净工作台风口或吹风机冷风口),至乙醇完全挥
    发(侧面观察磁珠无反光;反面观察磁珠颜色由棕黑色变为深褐色,边缘龟裂;无液体挂壁)。
     室温晾干前,请先尽量吸净残液。乙醇残留会抑制后续的酶反应(如酶切、PCR 等)实验,应确保乙醇
    完全挥发后再进行下一步操作。但也不能干燥太久(磁珠不能完全龟裂),以免 DNA 难以洗脱。

    10. 从磁力架或磁铁上取下离心管,加入 100 μL 洗脱液,振荡混匀,65℃水浴 10 min,每隔 2-3
    min 轻摇离心管混匀 3-5 次。
     水浴前请先用洗脱液将离心管壁上的所有磁珠冲洗至离心管内。

     如有特殊需要,可使用等量的经高压灭菌的去离子水作为洗脱液。但应保证去离子水的 pH 值在 7.0-8.5
    之间,若 pH 值不在此范围内,会影响洗脱效率及 DNA 质量。

    11. 将离心管置于磁力架或磁铁上进行磁分离,小心吸取上清至新的离心管中,所得上清即目的基因
    组 DNA,可直接进行下游实验或于适当条件保存。
     可先将离心管 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再进行磁分离,以确保所有磁珠完全吸附至管壁。

     尽量吸净上清,但请勿吸入磁珠,以免影响基因组 DNA 的纯度及 DNA 溶液的颜色。

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    版本 2019/01/15(01)
    【常见问题及参考意见】
    1. 得率低  土壤样品保存不当:新采取的土壤样本会得到更高的得率,不同样本在采样前应先查阅相应的最佳保存
    条件;
     
     结合不充分:结合过程中要使磁珠一直处于悬浮状态,并且充分颠倒混匀;

     取样量大于说明书给出量:取样量请严格按照说明书操作;
     操作过程中磁珠损失:操作过程中可能有少量磁珠沾在离心管管口或枪头上,应及时确保磁珠重悬至溶液
    中,避免磁珠损失;

    洗脱液 pH 不在推荐范围内:应使用本试剂盒配套洗脱液,如有特殊需要,可使用等量的经高压灭菌的去离子
    水作为洗脱液。但应保证去离子水的 pH 值在 7.0-8.5 之间,若 pH 值不在此范围内,会影响洗脱效率;

    洗脱温度不符合要求:洗脱过程需要 65℃水浴。65℃条件下磁珠与基因组 DNA 的作用力减弱,释放吸
    附的大量基因组 DNA,而常温条件下只能少量的基因组 DNA。

    2. D条带弥散,DNA 断裂、降解  样品不新鲜:请尽量选择新鲜的样品;

     裂解时间太长:裂解时间不要超过 60 min;

     样品没有按要求保存或反复冻融:需要保存的样品请分装后保存至相应的最佳条件,避免反复冻融造成 D
    A 降解;
     
     操作过程过于剧烈:操作过程动作尽量温和,避免 DNA 被机械打断;

    提取后模板 DNA 放置时间太长:提取后如有需要,请尽量及时进行凝胶电泳实验。短期内可置于 4℃保存,
    长期请置于-20℃保存(尽量注意避免反复冻融)。

    3. DNA 溶液有颜色  洗涤过程不充分:如果结合后磁珠呈团状、丝状或颗粒状,可适当增加振荡力度及次数;

     裂解不充分:将组织充分研磨、适当增加裂解液 S06 和 S2 用量,也可以延长裂解时间;

     样品用量大于说明书给出量而其他试剂用量没有相应调整:严格按照说明书操作,如果需要增大样本量,可以
    等比例大裂解液 S06、S2 以及磁珠用量,其他试剂用量可不改变;
     
    DNA 溶液中混入磁珠:洗脱结束后,可先将离心管 10000 rpm 离心 1 min,再进行磁分离,以确保所有
    磁珠完全吸附至管壁。为防止吸入磁珠,可重复进行磁分离一次。

    4. DNA 样品不纯,干扰后续实验  DNA 溶液有乙醇残留:吸弃废液时,请尽量吸净管盖及管底残液。为缩短后续晾干时间,可将离心管
    10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再置于磁力架或磁铁上进行磁分离,再次吸弃废液。室温晾干至磁珠
    表面无反光、无液体挂壁;

     磁珠洗涤不充分:加入 70%乙醇时,请确保所有磁珠均重悬于液体中,并充分振荡混匀;

    DNA 溶液中吸入磁珠:如果不小心吸入磁珠,请将上清液返回原管,待磁珠完全吸附至管壁后重新吸取上
    清。或者将吸取的上清液 10000 rpm(~6953×g)离心 1 min,再取上清;

     DNA 溶液中含有蛋白质等杂质:建议适当减少样品用量;

    DNA 溶液中含有轻微盐离子等杂质,此为洗脱液正常现象,不影响下游实验。如有特殊需要,可使用等量的
    经高压灭菌的去离子水作为洗脱液。为方便实验,可将获得的 DNA 溶液置于-20℃环境分装保存。

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