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- 2025年07月15日
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文献和实验做 ChIP（Chromatin Immunoprecipitation）已经几个月了，虽时间不长，但深刻体会细节决定成败，这里就把自己认为值得注意的细节总结如下： 1、cell counting：尽量做到准确，会影响 input 结果。 2、cross link：甲醛的终浓度是 1%，这个基本所有的 protocol 上都会强调。 3、resuspend cells with SDS:一定要选用小的 tip 头，在液面下吹打，否则很容易产生气泡，后面的 sonication 就麻烦
做ChIP（Chromatin Immunoprecipitation）几个月，时间不长，但深刻体会细节决定成败，把自己认为值得注意的细节总结如下：1、cell counting：尽量做到准确，会影响input结果。2、cross link：甲醛的终浓度是1%，这个基本所有的protocol上都会强调。3、resuspend cells with SDS:一定要选用小的tip头，在液面下吹打，否则很容易产生气泡，后面的sonication就麻烦了。4、sonication：ChIP中最重
Determination of Protein Contacts by Chemical Cross‐Linking With EDC and Mass Spectrometry
.1 The mechanism of condensation (cross‐linking) reaction between a protein side chain carboxyl (I) and amine (II) group. (A ) Reaction with EDC alone. (B ) NHS forms a more stable active ester (V) and increases the yield of the isopeptide (cross‐link) bond (IV
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