N-芴甲氧羰基-D-天冬氨酸-1-甲酯,368443-82-

酶活性位点催化残基特征分析

精准，这有助于催化。精氨酸侧链还具有良好的几何结构，可以稳定磷酸基上的一对氧原子，磷酸基是一种常见的生物基团。半胱氨酸（有自由巯基的）在催化残基中占比 5.6%，而它自然丰度只有 1.2%。综上所述，组氨酸和半胱氨酸都有着最高的可能成为催化残基，接下来就是带电残基，然后再就是极性残基，极性残基之后就是一些疏水氨基酸。侧链和主链相互作用在催化残基中，有 92% 的残基都用到侧链相互作用，剩下的 8% 则是主链相互作用。在那些用到主链相互作用的残基中，82% 通过的 N-H 基团，18% 通过 C = O

环肽的合成方法

。1.1.2 N-羟基琥珀酰亚胺酯法：该方法原理与对硝基酚法一致，唯一不同点在于线性多肽的C端羧基在缩合剂EDC的存在下与N-羟基琥珀酰亚胺（HONSu）缩合，形成直链多肽的N-羟基琥珀酰亚胺酯。应用这种方法Toshihisa等在吡啶溶液中合成了cyclo（Pro-Val-Pro-Val）和cyclo（Pro-D-Val-Pro-D-Val），收率分别为15%和12%。二者为非对映异构体，前者具有植物生长抑制作用，后者却表现为植物生长促进作用。1.1.3五氟苯酚酯法：这类活泼酯用于环肽的合成是近年才发展

基于极性与非极性氨基酸的“二元组图” 进行蛋白质设计

中的所有序列具有同样的极性和非极性残基图形。遗传代码（图 9.2 ) 的组成分布使得这种序列简并性成为可能。简并密码 NTN 编码非极性氨基酸残基，而简并密码 NAN 编码极性氨基酸残基（N 表示 A、G、 T、C 的混合物；见 9.2.2 节中相关密码子的利用）。利用这些简并密码子，非极性位 置上的氨基酸可以是苯丙氨酸（Phe)、亮氨酸（Len)、异亮氨酸（lie )、甲硫氨酸 (Met) 或者缬氨酸（Val)；而极性位置的氨基酸则是谷氨酸（Glu)、谷氨酰胺 (Gin)、天冬氨酸（Asp