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- 详细信息
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大量
- 英文名:
White Sturgeon Iridovirus(WSIV) SYBR qPCR Kit
- 保质期:
一年
- 供应商:
上海钰博生物科技有限公司
- 保存条件:
-20℃保存
- 规格:
50次
White Sturgeon Iridovirus(WSIV) SYBR qPCR Kit
高首鲟虹彩病毒(White Sturgeon Iridovirus,WSIV)会引起高首鲟虹彩病毒病,主要是水平传播,通过水平途径在水体、饵料和鱼体间进行传播和感染,主要危害幼鱼,发病后死亡率高达37.9%。病鱼体色变黑,嗜睡,贫血症状明显;体表和鳃出血,鳃上有瘀斑,呈灰白色;脾脏肥大。病毒对鱼体上皮组织和内皮组织亲嗜性较强,对脾脏、肾脏等鱼类造血器官和组织的破坏尤为严重,从而导致病鱼贫血、多器官衰竭而死亡,因此高首鲟虹彩病毒的快速准确鉴定对该病的预防和检疫有着重要作用,为此本公司开发了简单快捷的高首鲟虹彩病毒染料法荧光定量PCR检测试剂盒,它具有下列特点:
1. 即开即用,用户只需要提供病毒 DNA 模板。
2. 引物根据高首鲟虹彩病毒专一区设计,特异性高。
3. 荧光定量 PCR 检测,比常规 PCR 更加灵敏。
4. 一管式闭管操作,降低了交叉污染。
5. 本试剂盒足够 50 次 20μL 反应体系的荧光定量 PCR。
6. 本产品只适用于科研,不能用于临床诊断。
| 编号 | 成分 | 规格 |
| 试剂一 | 2×qPCR MagicMix | 500 μL(棕色管) |
| 试剂二 | 荧光 PCR 专用模板稀释液 | 1 mL(黄盖) |
| 试剂三 | 高首鲟虹彩病毒PCR 引物混合液 | 100 μL(白盖) |
| 试剂四 | 高首鲟虹彩病毒PCR 阳性对照(1×10E8 拷贝/μL) | 50 μL(黄盖) |
| 试剂五 | DNA病毒裂解液(试用装) | 15次(9 mL) |
| 使用手册 | 1 份 |
运输及保存 低温运输、-20℃保存,有效期一年。
自备试剂 DNA 模板、10×ROX(根据机型决定,具体见使用方法)。
使用方法 一、稀释 PCR 阳性对照(以 10E2-10E7 拷贝/μL 这 6 个 10 倍稀释度为例)
1. 注意:由于标准品浓度非常高,因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行,千万 不能污染样品或本试剂盒的其他成分)。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原, 本产品不提供活体样品做阳性对照,只提供可以直接使用的 DNA 片段作为阳性对 照。
2. 标记 6 个离心管,分别为 7,6,5,4,3,2。
3. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液(最好用带芯枪头,下同)。
4. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照,充分震荡 1 分钟,得 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
5. 换枪头,在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得), 充分震荡 1 分钟,得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
6. 换枪头,在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照到 5 号管中,充分 震荡 1 分钟,得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
7. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品 DNA 的制备
8. 如果有 N 个样品,必须设置 N+2 个提取,多出的一个是 PC(样品制备阳性对照), 一个是 NC(样品制备阴性对照)。可以用 10μL 上步制备的 PCR 阳性对照的第 4 号(浓度为 1×10E4 拷贝/μL,10μL 相当于 1 万拷贝)或第 5 号(浓度为 1×10E5 拷贝/μL,10μL 相当于 10 万拷贝)再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求 的体积一样,以此作为 PC。另外用水作为 NC。如果每次制备需要 200μL 样品, 则 PC 和 NC 的体积也必须是 200μL。
9. 用自选方法纯化样品的 DNA,本试剂盒跟市场上大多数病毒 DNA 提取试剂盒兼 容。也可以选购本公司的一管式病毒 DNAout 或其升级版柱式病毒 DNAout。本 试剂盒免费赠送 15 次一管式病毒 DNAout,
三、设置 qPCR 反应(20 μL 体系,在样品制备室进行)
10.如果只做 1 次重复,则标记 N+9 个 PCR 管,其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个 样品,1 个用于 PCR 阴性对照,6 个用于 PCR 阳性对照。如果做 2-3 次重复,则 反应设置数量相应增加 2 或 3 倍。
11.在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕 后才设置阳性对照,并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后最后加):
| 成分 | 样品管 N+2 个 | PCR 阴性 对照管 | PCR阳性对照管(2-7 管) |
| 2×qPCR MagicMix | 10μL | 10 μL | 各 10 μL |
| 高首鲟虹彩病毒PCR引物混合液 | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| 自备 10×ROX (见注) | 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
| N+2 待测样品 cDNA 模板 | 6 μL | 不加 | 不加 |
| 第 7 步所得 PCR 阳性对照 稀释液(2-7 号) |
不加 | 不加 | 各 6μL(2 号样到 2 号管,3 号样到 3 号管…) |
12. 盖上盖子后上机,按下面参数进行 PCR(具体 PCR 参数可以根据仪器不同而自行优化)。
| 过程 | 温度 | 时间 |
| 预变性 | 96℃ | 5 分钟 |
PCR 反应 (30 个循环) |
94℃ | 60 秒 |
| 54℃ | 60 秒 | |
| 76℃ | 60 秒 |
具体操作按所用仪器推荐的流程进行。本产品中所含的荧光染料在不结合 DNA 时,最大吸收光谱在 471 nm,结合 DNA 时的最大吸收光谱在 500 nm,最大发射光谱在 530 nm。信号采集可以设置在复性或延伸步骤。
四、数据处理
14. 如果把本试剂盒用于定量检测,则以阳性对照浓度的 log 值为横轴,以 Ct 值为纵 轴,绘制标准曲线。再以待测样品的 Ct 值从标准曲线上推算出样品 DNA 浓度的 log 值,再推算出其浓度。
15. 如果把本试剂盒用于定性检测,只判断阳性或阴性,则阴性对照 Ct 必须大于或等 于 40。阳性对照必须有荧光对数增长,有典型扩增曲线,Ct 值应该小于或等于 30。对待测样品,如果其 Ct 大于或等于 40 则为阴性,如果小于或等于 35 则为 阳性。如果在 35-40 之间,则重复一次。重复实验的 Ct 值如果大于或等于 40 则 为阴性,如果小于 40,则为阳性。
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文献和实验PCR产物的荧光值就可以。参比染料的作用是标准化荧光定量反应中的非PCR震荡,校正加样误差或者是孔与孔之间的误差,提供一个稳定的基线。现在很多公司已经把ROXTM配制在MasterMix或者Premixture里。如果反应曲线良好或已经优化好反应体系,也可以不加ROXTM染料校正。通常来讲,real-time qPCR的反应程序不需要像常规的PCR那样,要变性、退火、延伸3步。由于其产物长度在80-150bp 之间,所以只需要变性和退火就可以了。SYBR@Green等染料法,最好在PCR扩增程序结束
(因为在处理过程中RNA极易降解,建议体系中加入适量RNA酶抑制剂。 实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)实验流程 一、RNA的提取(详见RNA提取及反转录) 不同组织样本的RNA提取适用不同的提取方法,因为Real-Time PCR对RNA样品的质量要求较高,所以,正式实验前要选择一款适合自己样品的提取方法,在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。 在总RNA的提取过程中,注意避免mRNA的断裂;取2ug进行RNA的甲醛
出来,荧光急剧减少。3、在聚合延伸过程中,引物退火并形成PCR产物。4、聚合完成后,SYBR Green染料与双链产物结合,定量PCR系统检测到荧光的净增量加大。 SYBR Green I荧光染料能与所有的DNA双链相结合,对DNA模板没有选择性,所以特异性不如TaqMan探针。要想用荧光染料法得到比较好的定量结果,对PCR引物设计的特异性和PCR反应的质量要求就比较高。在此前提下,本法是一种成本低廉的选择。
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