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再生医学靶向库
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Regenerative Medicine Focused Library
23000
Chemdiv
1mg
再生医学从诞生起就备受瞩目,修复受损的组织和器官,给医学界带来巨大的变革。不过再生医学领域依然处在起步阶段,对细胞分化机制的研究还不够全面和清晰,再生医学走向临床似乎还有很长的路。不过随着小分子成功调节细胞分化和重编程,再生医学领域又有了新的曙光。目前已报道多种小分子化合物具有促进细胞增殖分化的作用,如XMU-MP-1可以促进肝脏修复再生,处于临床阶段的FX-322能够恢复神经性听力损失。另外还有多种小分子同时使用能够诱导体细胞重编程的相关报导。与细胞因子与基因工程等相比,小分子调节剂用于再生医学研究和临床应用的难度更低,并且更有可能大规模生产和使用,惠及全人类。
陶素生化再生医学靶向库基于现有化合物和靶点的基础上,通过计算机虚拟筛选和药效结构分析等方法,从Chemdiv 160万种类药性化合物中筛选出约23000种潜在的再生医学调节剂。严格筛选是提高命中率的重要保证,再生医学靶向库同样经过了严格的筛选步骤。蛋白靶点和结构信息源自常用的Swiss-Prot和PDB数据库;大量分析学习各数据库(ChEMBL 25, PubMed和现有文献)中明确报道的再生医学相关的活性小分子。具体筛选步骤如下:
1)计算机数据学习管理:a) KNIME/RDKit, kNN classifier, Distance in BitVector Cosine Space, FCFP12 (10,240 bit) fingerprints; b) Hybrid 2D QSAR/Fingerprint Model - Kernel Chemical Classification/Regression (kcc)
2)3D形状相似性虚拟筛选;
3)基于结构的(配体,片段,共价片段)对接/虚拟筛选;
4)REOS,MedChem和PAINS过滤器:去除反应性,有毒,混杂和其他不良结构基团;
5)多样性挑选 (Tanimoto)。
陶素生化再生医学靶向库可以用于再生医学相关的药物研发工作,为再生医学研究提供有力的研究工具。
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