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- 2026年01月26日
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上海达为科生物科技有限公司
- 服务名称：
基因芯片
| 项目分类 | 名称 | 描述 |
| Illumina SNP芯片 | Human omni-zhonghua-8 beachip | 包含90万个位点 |
| Agilent表达谱芯片 | Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60K V2 | 涵盖50,599条转录本信息 |
| Agilent SurePrint G3 Mouse Gene Expression 8×60K | 涵盖55,681条转录本信息 | |
| Agilent SurePrint G3 Rat Gene Expression 8×60K | 涵盖30,003条Entrez Gene RNAs | |
| Agilent miRNA芯片 | Agilent Human miRNA Array V19.0 | 覆盖2006个人类相关miRNA |
| Agilent Rat miRNA Arrary V19.0 | 覆盖719个大鼠相关miRNA | |
| Agilent Mouse miRNA Array V19.0 | 覆盖1247个小鼠相关miRNA | |
| Agilent 定制miRNA Array V19.0 | 可以定制数据库包含的各个物种的相关miRNA | |
| Illumina人DNA甲基化芯片服务 | IlluminaInfinium Human Methylation450 BeadChip | 包含了450,000多个甲基化位 |
数据分析（以miRNA芯片分析为例）
标准分析
芯片预处理与标准化；
筛选差异表达microRNA；
microRNA聚类图、火山图以及热图等；
microRNA靶基因预测，基于多数据库整合的靶基因预测以及上海丰核自主知识产权的预测软件同时识别；
对预测的microRNA的靶基因进行GO富集分析通路富集分析等。
个性化分析
1.microRNA网络分析：microRNA靶基因失调网络；microNRA功能协同作用网络。
2.microRNA与其他芯片整合分析：与lncRNAs芯片结果联合分析（ceRNA Analysis）；与mRNA芯片整合分析；与DNA甲基化芯片结果联合分析。
3.与临床数据整合分析。
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文献和实验wenzhu24 本人正准备进行课题设计，找到了一个比较感兴趣的抑癌基因，但是不清楚它在我所研究肿瘤中的表达情况。后来看到了我们实验室做的一个关于肿瘤和癌旁组织的基因芯片（需要注明的是由于经费问题只做了一组癌和癌旁组织），发现这个基因在癌和癌旁组织的改变不明显。想咨询各位：仅仅一组癌和癌旁组织的基因芯片是否能够做参考？这个基因在癌中的表达就真得没有变化呢？ ebio66 一对样本太少，说明不了问题。建议再做上几个样本的RT
基于基因芯片的酶反应方法 在ASO的基础上，又衍生出了一些基于基因芯片的酶反应方法，用于SNP的分析。与直接杂交法不同的是，基于酶 学方法的基因多态性检测允许探针的3’端或近3’端设计突变碱基。一旦探针的3’端和靶基因序列互补，连接酶和多聚酶能够引导序列的延伸，这种特性可以用来区分不同靶基因的序列。这种方法被称为酶催化的延伸法，主要有引物延伸法和连接酶检测反应。基于这两种方法又发展了其他的基因芯片基因多态性检测手段，这里只介绍上述两种方法。 (1)引物延伸法
liuwenbinahslyy 基因芯片数据分析时，比值大于2.0或者小于0.5被认为是有表达差异，为什么要相差两倍呢？这个比值与PCR或Western blot验证时的基因或蛋白表达差异是否是一致的(即是否也是相差两倍以上)？按理说PCR或Western blot检测表达差异根本不需要相差两倍以上，这还取决于重复实验的次数及数据的分布情况。 zjubell liuwenbinahslyy wrote
