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文献和实验Asn Asparagine AAT,AAC P Pro Proline CCT,CCC,CCA,CCG Q Gln Glutamine CAA,CAG R Arg Arginine CGT,CGC,CGA,CGG,AGA,AGG S Ser Serine TCT,TCC,TCA,TCG,AGT,AGC T Thr Threonine ACT,ACC,ACA,ACG V Val Valine GTT,GTC,GTA,GTG W Trp Tryptophan TGG X Xxx Unknown Y
由计算机阅读此类从 3’到 5’端排列的显性序列是荒堂的。 PDB 记录中的隐性序列蕴涵在由 PDB 文件中的 ATOM 记录及相应(X,Y,Z)位置坐标构成的化学立体结构中。 关于序列的记录 例如:…… SEQRES 1 A 21 GLY ILE VAL GLU GLN CYS CYS THR SER ILE CYS SER LEU SEQRES 2 A 21 TYR GLN LEU
)Fmoc-Ser-D-Val-Leu)的合成过程如下: DPPA系二苯基磷酰基迭氮化物,是一种稳定的液体,沸点157℃,用二苯基磷酰氯和NaN3在丙酮中室温反应很方便地得到,可以直接用作多肽偶联的缩合剂,近年来多用于环肽的合成。 Arg-Gly-Asp(RGD)是多种细胞外蛋白与整合素相互作用时被整合素识别的关键序列,对含有该序列环肽的合成报道很多。Kessler等用固相合成仪SP650合成了13个含RGD序列的线性六肽和七个含RGD序列的线性五肽,N端和C端均游离的直链肽在稀溶液中以DPPA
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