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文献和实验2. 次优样品分离。(A) 负载影响条带分辨率。 (B) 上样量过低会导致条带扭曲。 在上样缓冲液中准备好样品和分子量标准,其最终的体积通常占胶孔体积的 30%。由于孔底分布不均匀(图 2B),使用较少的上样体积会导致条带扭曲。对于含有 DNA 结合蛋白或粘性末端的样品,凝胶上样之前,混合物需加入至 含有 SDS 的上样染料中一同加热,因为蛋白质结合以及 DNA 片段之间的相互作用会导致分离效果不佳。 c .上样染料和缓冲液选择 制备凝胶电泳时,样品中添加了凝胶上样缓冲液 (通常是 6X 或 10
C左右,然后加入碘乙酰胺。通常我们在100 μl样品中加入10 μl 20%(w/v)的碘乙酰胺水溶液,并在室温下孵育30分钟。 通过这一步,我们可以获得更为锐利的条带,并排除了一些假象,如两条带、其他的高分子量条带、点样孔中的沉淀,以及凝胶上的线。 4. SDS电泳中运行缓冲液的滴定 到目前为止,大部分单向和双向SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的应用是在基于Lämmli的不连续缓冲液系统中开展的[1]。其他基于磷酸盐、咪唑或其他缓冲液的均一系统表现
: a)氯(-),由胶缓冲液提供,充当快速移动的先导离子。b)MES或MOPS(-),(取决于电泳缓冲液的选择)充当后随离子。MES: 2-(N-morpholino)ethane sulfonic acidMOPS: 3-(N-morpholino)propane sulfonic acidc)Bis-Tris碱(+)充当出现在胶中的共同离子,Tris(+)由电泳缓冲液提供。合并低pH值的胶缓冲液(pH6.4)和电泳缓冲液(pH7.3-7.7)导致了电泳时显著降低的工作pH值。图2 NuPAGE®
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