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文献和实验近年来,ZFN、TALEN、CRISPR/Cas9等基因组编辑技术可谓是层出不穷,尤其是CRISPR/Cas9,一出现便在全球范围内掀起一股热潮。同时,各大公司也开发出一系列相应的产品,其中一种至关重要的就是基因敲除阳性克隆筛选的试剂。 目前,市面上只有Genloci的Cruiser™、Transgenomic的SURVEYOR和NEB的T7EI这三种产品和测序这种方法,被用于基因敲除阳性克隆的筛选。然而,SURVEYOR是进口产品,价格贵,货期长;T7EI可以识别多种DNA结构,如十字
。如今市面上只有Cruiser™和Surveyor两个品牌。因为Cruiser™价格合适,且相比于进口代理产品拥有货期短的优点(国内可以2-3天内到货),做到真正质优价廉。 据了解,另一种被广泛应用于基因敲除筛选的X酶,其最早并不是为了做基因敲除筛选而生产的。它除了识别错配外,还可以识别十字型结构 DNA、Holliday 结构或交叉 DNA、异源双链 DNA,正是因为这个特点,很容易导致假阳性的现象。 图1. Holliday交叉(Holliday junction),无错配结构
每年到修改论文的时候,发现很多同学不懂图形和数据处理,出来的图形惨不忍睹。有的人想学没处学,有的根本不想学,最后的结果是研究生给本科生干活,老师给学生干活。所以有空的时候,想以这种方式写一点数据处理技术,给自己的未来减负。先从最简单的单X多Y图说起。 实验过程中经常遇到系列样品的表征数据,比如红外光谱、X-射线衍射等等,通常这些仪器测定的步长一致,也即X轴完全相同,这时候可以把系列数据绘制在一个图形中,图形的信息量丰富,也方便数据比较。例如这次本科论文中有一位同学的一组红外数据
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