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GeneCopoeia
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HDR 供体克隆载体
同源重组(HR)是一种修复 DNA 双链断裂(DSB)的自然机制。靶向特定位点的 TALEN 或 CRISPR-Cas9 体系能够在基因组上生成 DSB,触发 DNA 的自然修复机制,诱导基因组与供体 DNA 之间发生同源重组(HR),将供体DNA 片段整合到基因组上的靶标位点来修复 DSB。
这个过程对基因组编辑操作具有极大的价值。按照实验需求构建的各种供体质粒能在基因组序列中引入多种的修饰。研究者能通过整合报告基因或筛选标记干扰基因的编码区序列,达到基因敲除的目的,或通过敲入突变序列进行各种阅读框操作,或者在内源基因序列上融合标签以对基因进行追踪等等。(图1)

图1. 同源重组介导的基因组编辑。 通过CRISPR/TALEN工具制造DNA 双链断裂介导同源重组,将供体克隆上的报告基因和筛选标记表达结构靶向整合到基因组上的目标位点。
GeneCopoeia 提供标准或客户定制的供体克隆载体,用于基因敲除、突变修饰、融合标签及其他方面的应用。我们提供带有不同元件的多种载体骨架,可供客户根据自己的实验需要进行选择。
- 两个多克隆位点(MCS),用于装载左侧及右侧同源臂序列。
- 含GFP(可选)等报告基因,用于阳性克隆细胞分选。
- 含筛选标记,如嘌呤霉素和新霉素抗性基因,用于筛选阳性克隆。
- 含TK 筛选标记(可选),用于负筛选去除含有随机整合的克隆。
- 含 LoxP 位点(可选),方便在后续实验中通过Cre-LoxP重组去除整合到基因组中的筛选标记或报告基因序列。
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文献和实验基因工程所用的克隆载体常称之为分子克隆载体(molecular cloning vector),它是一类可供外源DNA插入并携带重组DNA分子进入适当宿主细胞的DNA分子。如果打一个十分浅显的比喻,分子克隆载体犹如航天技术中的运载火箭,外源DNA分子就如火箭上搭载的卫星,宿主细胞则如外部深邃的空间。分子克隆载体的主要功能就是将外源基因携带入宿主细胞,并在宿主细胞中进行DNA扩增和使外源基因得以高效表达。在这一点上又与火箭不一样,因为火箭在运载卫星的过程中分级脱落和烧毁。 尽管克隆载体
信息。因此,只有在这一段中可插入外源DNA而不致影响噬菌体的活性。用M13作为分子克隆载体的优点是从细菌中释放出来的噬菌体颗粒只含单链DNA,其中包含了克隆DNA片段的二条互补链中的一条,因此可用来作为对DNA测序的模板。另外,可用来产生单链的DNA探针以选择和分离互补的RNA。M13的RF型是双链DNA,便于限制酶的识别和切割,克隆进双链的外源DNA。从细菌培养液中大量抽取单链DNA。问题是插入M13的外源DNA超1000bp时就不稳定,在噬菌体增殖时会出现缺失。一般说,插入300~400bp是相当稳定的。 (三
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