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affymetrix昂飞人类基
1. - 四条边明暗交替模式、拐角棋盘模式 - 左上角芯片名称清晰2.背景平均值(Average Background)和噪音值(Noise Values)典型的背景平均值范围在 20 到 100 之间。来源于相同扫描仪应该有可比较的噪音值。结果显示在.rpt 文件中。 3) Poly-A Controls: lys,phe,thr,dapPoly-A RNA Controls 用来监控全程的标记过程. lys,phe,thr,dap 的 3’端都应该表达(Detection 为 P)。结果显示在.rpt 文件中。4) 杂交对照:bioB,bioC,bioD,and crebioB,bioC,bioD 代表 E.coli.生物素合成通路中的基因。bioC,bioD,and cre 应该总是检测到并以递增的信号强度表达,来反映它们相对的浓度。结果显示在.rpt 文件中。5) 内参照基因 Sig(3’/5’)比值检测对于大多数的表达芯片,ß-Actin 和 GAPDH 两个基因被用来评估样品制备的质量。二者探针组的 3’/5’比值至少一个小于 3。ß-Actin 和 GAPDH 的 3’/5’比值显示在.rpt 文件中。6) 总体基因的表达率不能低于 20%。7) RNA, cRNA QC 电泳图 符合质控要求d 数据分析信号通路分析信号通路网络分析聚类分析
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