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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 库存:
436
- 英文名:
First strand RT-PCR premix for fluorescent quantitation
- 保质期:
一年
- 供应商:
北京百奥莱博科技有限公司
- 保存条件:
-20℃
- 规格:
20μl×50次
特别提示:包括荧光定量用第一链反转录预混合液在内,本公司的所有产品仅可用于科研实验,严禁用于临床医疗及其他非科研用途!
产品名称:荧光定量用第一链反转录预混合液
英文名称:First strand RT-PCR premix for fluorescent quantitation
产品货号:ALH264
产品规格:20μl×50次
本品为一管式反转录预混Mix,5×RT MasterMix 中含有反转录第一链合所需的所有试剂(RTase、RNase Inhibitor、Random primers、Oligo dT Primer、dNTP Mixture、反应Buffer),加入模板RNA 和RNase-Free H2O 即可进行反应。使得cDNA 的合成更加的方便快捷,特别适合cDNA 合成以后的两步法Real Time PCR 检测。
试剂盒组分:
5 ×RT MasterMix————————0.2ml
RNase free H2O—————————1ml
产品特点:
1.体系配制简单:本产品为预混Mix形式,只需加入模板RNA和水便可以进行反应。
2.反转录效率高:特殊优化的oligo dT和N6随机引物配比,反转录效率高。
3.反转录速度快:只需42℃,20 min即可完成cDNA第一链的合成。
4.通读复杂模板:能够用于GC含量高,二级结构复杂的RNA模板,合成cDNA片段长度zuì高可达12 kb。
5.后续兼容性好:后续配合荧光定量检测产品,灵敏度高、稳定性好。
储存条件:-20℃,有效期一年。
除了荧光定量用第一链反转录预混合液,,我公司还供应以下相关产品:
名称:石蜡包埋组织直接RT-PCR试剂盒(免RNA提取)
货号:BTN131176
规格:30次
名称:NTP溶液(10mM)
货号:BTN70906
规格:0.5mL
本产品是ATP、UTP、GTP、CTP四种核苷酸的混合液,每种核苷酸的浓度为10mM,纯度在98%以上(HPLC检测),不含DNA内切酶、DNA外切酶、RNA酶和磷酸酶的污染,可以直接用于体外RNA转录合成。使用浓度请参考相关手册。
储存条件:低温运输、-20℃保存,有效期两年。
NTP的分子结构
名称:KOD DNA聚合酶
货号:ALH209
规格:250U|500U
本酶是从克隆有Thermococcus Kodakaraensis DNA聚合酶基因的质粒在大肠杆菌中经诱导表达分离纯化而来。该酶所具有的超强3"→ 5"外切酶活性使得其扩增保真性比Pfu DNA Polymerase 更高,保真性是Taq的约50倍,同时具有合成速度快的特点,聚合速度约为普通Pfu DNA Polymerase的5倍,Taq DNA Polymerase的2倍,达到100~138bp/秒,可以在短时间内获得高产量的扩增产物,特别适合于高保真地扩增6kb以内的PCR 产物,扩增所得的DNA为平末端,可用于基因克隆、表达及突变分析等分子生物学实验。高保真KOD对于dNTP纯度要求很高,因此建议用本酶配套的超纯dNTP mix。
产品组分:
KOD DNA Polymerase————————————250U
10×KOD Buffer——————————————1ml
SuperPure dNTP mix(10 mM Each)——————0.1ml
单位定义:75℃活性测定条件下,在30min内摄入10nmol的dNTPs使成为酸性不溶物时所需要酶的活性定义为1U。
储存条件:-20℃。
本制品别名:KOD酶
名称:高保真DNA聚合酶
货号:SY0057
规格:100U
Pfu DNA Polymerase 是基于Pfu DNA Polymerase改造而成的新一代超保真DNA聚合酶,具有极高的扩增效率和广泛的模板适应性,可用于几乎所有PCR反应。其行进性 (processivity)得到了大幅度提升,即使是非常复杂的模板,也能准确快速的完成反应。其错配率是普通Taq酶的1/53,是Pfu酶的1/6;
与上一代Pfu DNA Polymerase相比,Pfu中添加了独特的延伸因子、特异性促进因子以及平台期解抑制因子,使其长片段扩增能力、扩增特异性性以及扩增产量方面得到了大幅度提升:1)使用λDNA、质粒等简单模板,Pfu 可以有效扩增长达40 kb的片段;2)使用基因组DNA等复杂模板,Pfu可以有效扩增长达20 kb的片段;3)使用cDNA模板,Pfu可以有效扩增长达10 kb的片段。此外,Pfu对PCR抑制剂具有良好的抵抗能力,可用于细菌、真菌、植物组织、动物组织或全血样品的直接PCR。II Pfu中添加了在常温下能够抑制其5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性的两种单克隆抗体,可进行高特异性的热启动PCR。
该酶具有5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性,扩增产物为平端。
产品组份:
Pfu DNA Polymerase(1 U/μl):100 μl
2×PCR buffer:1.25 ml×2
dNTP Mix(10 mM each):100 μl
10×Loading buffer:1.25ml
活性定义:用活性化的大马哈鱼精子DNA作为模板/引物,74℃30分钟内,摄入10 nmol的全核苷酸为酸性不溶物的活性定义为1个活性单位(U)。
质量控制
核酸外切酶残留检测:10 U本品和0.6 μg λ-Hind Ⅲ在74 ºC下孵育1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
核酸内切酶残留检测:10 U本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在74 ºC下孵育1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
大肠杆菌残留DNA检测: 50 μl体系中,加入2U本品,以ddH2O为模板,扩增E.coil 16s rDNA基因。35个循环后扩增产物进行1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,无扩增条带。
功能检测1:50 μl PCR体系中加入1U本品,以100 ng人基因组DNA为模板扩增30个循环,1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,观察到单一的8.2 kb条带。
功能检测2:50 μl PCR体系中加入1U本品,以10 ng λDNA为模板扩增30个循环,1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,观察到单一的15 kb条带。
1 推荐反应体系及反应程序
1.1 反应体系配制:
a. 所Pfu DNA Polymerase 是基于Pfu DNA Polymerase改造而成的新一代超保真DNA聚合酶,具有极高的扩增效率和广泛的模板适应性,可用于几乎所有PCR反应。其行进性 (processivity)得到了大幅度提升,即使是非常复杂的模板,也能准确快速的完成反应。其错配率是普通Taq酶的1/53,是Pfu酶的1/6;
与上一代Pfu DNA Polymerase相比,Pfu中添加了独特的延伸因子、特异性促进因子以及平台期解抑制因子,使其长片段扩增能力、扩增特异性性以及扩增产量方面得到了大幅度提升:1)使用λDNA、质粒等简单模板,Pfu 可以有效扩增长达40 kb的片段;2)使用基因组DNA等复杂模板,Pfu可以有效扩增长达20 kb的片段;3)使用cDNA模板,Pfu可以有效扩增长达10 kb的片段。此外,Pfu对PCR抑制剂具有良好的抵抗能力,可用于细菌、真菌、植物组织、动物组织或全血样品的直接PCR。II Pfu中添加了在常温下能够抑制其5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性的两种单克隆抗体,可进行高特异性的热启动PCR。
该酶具有5’→3’聚合酶活性和3’→5’外切酶活性,扩增产物为平端。
产品组份:
Pfu DNA Polymerase(1 U/μl):100 μl
PCR buffer:1.25 ml×2
dNTP Mix(10 mM each):100 μl
10×Loading buffer:1.25ml
活性定义:用活性化的大马哈鱼精子DNA作为模板/引物,74℃30分钟内,摄入10 nmol的全核苷酸为酸性不溶物的活性定义为1个活性单位(U)。
质量控制
核酸外切酶残留检测:10 U本品和0.6 μg λ-Hind Ⅲ在74 ºC下孵育1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
核酸内切酶残留检测:10 U本品和0.6 μg Supercoiled pBR322 DNA在74 ºC下孵育1小时,DNA的电泳谱带不发生变化。
大肠杆菌残留DNA检测: 50 μl体系中,加入2U本品,以ddH2O为模板,扩增E.coil 16s rDNA基因。35个循环后扩增产物进行1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,无扩增条带。
功能检测1:50 μl PCR体系中加入1U本品,以100 ng人基因组DNA为模板扩增30个循环,1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,观察到单一的8.2 kb条带。
功能检测2:50 μl PCR体系中加入1U本品,以10 ng λDNA为模板扩增30个循环,1% 琼脂糖凝胶电泳,EB染色,观察到单一的15 kb条带。
1 推荐反应体系及反应程序
1.1 反应体系配制:
a. 所有操作请在冰上进行,各组分解冻后请充分摇匀。为了防止II Pfu DNA Polymerase的校对活性降解引物,请将聚合酶zuì后加入反应体系中。各组分使用完毕后及时放回-20℃。、
| ddH2O | to 50 μl |
| 2×PCR buffer a | 25 μl |
| dNTP Mix(10 mM each)b | 1 μl |
| 模板DNAc | optional |
| 引物1(10 μM) | 2 μl |
| 引物2(10 μM) | 2 μl |
| Pfu DNA Polymerase(1 U/μl)d | 1 μl |
【注】:a. 2×II PCR buffer中已含有Mg2+,终浓度为2mM。
b. 请勿使用dUTP和带有尿嘧啶的引物或模板。
c. 不同模板zuì佳反应浓度有所不同,下表为50 μl反应体系推荐模板使用量:
| 基因组DNA | 50 ng~400 ng |
| 质粒或病毒DNA | 10 pg~30 ng |
| cDNA | 1~5 μl(不超过PCR反应总体积的1/10) |
d. 推荐的酶的终浓度为1U/50 μl反应。然而,根据扩增子的长度和复杂程度不同,可将酶的使用量在0.5-2U/50 μl反应之间进行优化。II Pfu DNA Polymerase具有较强的校对活性,因此,如扩增产物需要进行TA克隆,加A之前必须进行DNA纯化。
1.2 一般PCR反应条件设置:
| 循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性a | 95℃ | 30 sec~3 min | 1 |
| 变性 | 95℃ | 15 sec | 25~35循环 |
| 退火b | 56℃~72℃ | 15 sec | |
| 延伸c | 72℃ | 30~60sec/kb | |
| 彻底延伸 | 72℃ | 5 min | 1 |
【注】:a. 推荐大多数模板的预变性温度为95℃,时间为:质粒或病毒DNA,30 sec,基因组/cDNA为3 min;
b.一般来说,退火温度设置为引物Tm值。如引物Tm值≥72℃,可删除退火步骤,直接进行后续的延伸步骤(两步法PCR)。如果需要,可以建立一个温度梯度反应去寻找zuì适引物模板结合温度。此外,退火温度直接决定扩增特异性。如发现扩增特异性差,可适当提高退火温度,每次+3℃。
c.延长延伸时间有助于提高扩增产量。
1.3 长片段PCR 扩增:
*使用高质量的模板,提高模板使用量;
*使用长引物。
*当推荐程序无法进行扩增时,建议尝试下述Touch Down两步法PC
*Touch Down两步法推荐反应条件设置:
| 循环步骤 | 温度 | 时间 | 循环数 |
| 预变性 | 95℃ | 3 min | 1 |
| 变性 | 95℃ | 15 sec | 5 |
| 延伸 | 74℃ | 60 sec/kb | |
| 变性 | 95℃ | 15 sec | 5 |
| 延伸 | 72℃ | 60 sec/kb | |
| 变性 | 95℃ | 15 sec | 5 |
| 延伸 | 70℃ | 60 sec/kb | |
| 变性 | 95℃ | 15 sec | 5 |
| 延伸 | 68℃ | 60 sec/kb | |
| 彻底延伸 | 68℃ | 5 min | 1 |
2. 复杂样品的扩增
Pfu具有卓越的长片段扩增能力、扩增特异性以及扩增产量,对许多PCR抑制剂具有良好的抵抗能力,可用于细菌、真菌、植物组织、动物组织或全血样品的直接PCR。推荐扩增的样品类型:
| 样品类型 | 扩增方式 | 推荐操作方式(50µl体系) |
| 全血 | 直接扩增 | 吸取1-5µl作为扩增模板 |
| 滤纸干血渍 | 直接扩增 | 剪取1-2mm2滤纸作为扩增模板 |
| 培养细胞 | 直接扩增 | 取少量细胞作为扩增模板 |
| 酵母 | 直接扩增 | 挑取单克隆或1µl菌液作为模板 |
| 细菌 | 直接扩增 | 挑取单克隆或1µl菌液作为模板 |
| 霉菌 | 直接扩增 | 挑取少量作为扩增模板 |
| 精液 | 直接扩增 | 吸取少量作为扩增模板 |
| 浮游生物 | 直接扩增 | 挑取少量作为扩增模板 |
| 植物组织 | 直接扩增 | 剪取1-2 mm2 组织作为扩增模板 |
| 小鼠尾巴 | 裂解后吸取裂解液扩增 | 吸取1-5 μl 裂解液作为扩增模板* |
| 食品 | 裂解后吸取裂解液扩增 | 吸取1-5 μl 裂解液作为扩增模板* |
*样品裂解液制备过程:
**Lysis Buffer:20 mM Tris-HCl,100 mM NaCl,1 mM EDTA,0.1% SDS,pH 8.0。(需自备)
引物设计注意事项
1)引物3’端zuì后一个碱基zuì好为G或者C;
2)引物3’端zuì后8个碱基应避免出现连续错配;
3)引物3’端尽量避免发夹结构出现;
4)引物的Tm值调整至55℃-65℃之间。
5)引物额外附加序列,即与模板非配对序列,不应参与引物Tm值计算;
6)引物的GC含量控制在40%-60%之间;
7)正向引物和反向引物Tm值以及GC含量尽可能一致。
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