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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 保存条件:
常温运输和保存
- 保质期:
两年
- 英文名:
PCR DNA Probe Labeling Kit
- 库存:
890
- 供应商:
上海烜雅生物科技有限公司
PCR标记的原理是用带标记的dNTP进行PCR,最后得到的PCR产物将带有标记,可以直接用于杂交试验。本产品就是基于上述原理的基础上开发,它具有下列特点:
1.一站式,本试剂盒提供经过优化的试剂,不需要用户自己摸索。
2.足够10次50uL体系的常规PCR(用于制备标记反应的模板和设置对照反应)和5次50uL体系的标记反应。
3.一次标记可以得到ug级的双链DNA探针或约700ng的单链DNA探针,足够多次杂交实验用。
4.既可用于制备双链探针,也可以用于单链探针。
5.A型需自备含标记核苷酸的dNTP,B和C型分别含生物素和Digoxin标记的底物。可用的自备标记底物包括fluorescein-dUTP、hydroxycoumarin-dUTP、resorufin-dUTP和aminoallyl-dUTP等。
6.掺入率一般为4-5%,有效降低了空间阻碍,检测效果最佳。
7.标记探针可以用于Southern和NorthernBlot、原位杂交、菌落和斑点印迹杂交等分析。
8.本产品足够5次非标记PCR和5次标记PCR(均指50uL体系)。

PCR法DNA探针Digoxin标记试剂盒运输及保存:
低温运输,-20℃保存,有效期一年。
自备试剂:DNA模板和模板专一性引物。
PCR法DNA探针Digoxin标记试剂盒使用方法
一:准备工作
1.按常规的方法设计PCR引物,使探针长度在400-800bp之间。过短则标记参入少,探针杂交信号强度减弱;过长则非特异杂交增加,背景变强。
2.由于标记的dNTP比较珍贵,所以不推荐以基因组DNA或其他复杂DNA为模板直接进行PCR标记,而是建议采取下述的两步法标记来提高成功率,即先制备非标记PCR产物,再以之为模板制备标记的PCR产物。
3.对A型标记试剂盒,四种10mM的dNTP是分开提供,用于制备50uL非标记dNTP(2mMeach,用于非标记PCR,用于制备标记PCR的模板。配制方法是四种10mM的dNTP各加10uL,再加水10uL即可)和25uL标记dNTP(2mMeach,其中标记核苷酸和对应的非标记核苷酸的比例需要自行优化,假如是biotin或DIG标记的是dUTP,则其对应的非标记核苷酸是dTTP,两者的最佳比例一般为1:3;如果是BrdUTP,则两者的最佳比例为1:1。配制方法是三种10mM的dNTP各加5uL,再加标记核苷酸和其对应的标记核苷酸使其总的终浓度为2mM,再补水到25uL)。
PCR法DNA探针Digoxin标记试剂盒二:非标记PCR产物的制备
4.设置50uL非标记PCR:2×标记专用PCRMix25uL,dNTPMix(2mMeach)5uL,自备的探针引物(10pmol/uL)各1uL,1ug基因组DNA或1ng质粒DNA,补超纯水到50uL。
5.按已经优化的PCR参数进行常规PCR。
6.胶回PCR产物并定量,胶回收可以避免残留引物干扰后续的标记PCR。
三:标记PCR反应(最好做一个不加标记的对照用于定量)
注意:由于双链PCR探针在杂交时变性的双链彼此还会复性,降低杂交效率,因此强烈推荐使用单链标记PCR。


PCR法DNA探针Digoxin标记试剂盒注意:本试剂盒提供的dNTP混合物总浓度为2mM,所含标记dUTP与非标记dTTP的比例已经进过优化。
7.按第5步的PCR参数进行标记PCR,但需要进行下列修改:一是循环数增加到35-55个循环。由于模板为纯化后的PCR产物,探针对扩增长度完整性要求不高(长度不均的探针由于能形成网络结构,效果反而更好),所以可以增加循环数;二是延伸时间增加15秒,因为标记dUTP参入到DNA的速度比常规的dTTP慢;三是降低复性温度5-7℃,因为标记核苷酸参入到DNA后,新模板的Tm值将降低。
8.标记探针的定量:取标记反应液和对照反应液1-5uL,在琼脂糖凝胶上跟浓度已知的DNAmarker一起电泳,并判断探针的浓度。由于标记产物中额外带有生物素,Digoxin等、其泳动速度将慢于非标记PCR产物(但同位素标记不能用此法)。下图是一个典型的双链PCR产物电泳结果图:

注意:如果扩增的是单链DNA探针,其结合EB的能力远低于双链DNA,因此EB染色的强弱不能准确反应DNA的真实浓度,可以采用银染定量(跟marker比较)。一般100ng模板经单链PCR扩增可得到700ng左右探针。
9.剩余的PCR标记产物可以不经过纯化,直接加入(对单链PCR探针)杂或加热变性并急冷后加入(对双链PCR探针)到杂交液中使用。也可放-20℃长期保存。如果需要纯化,请使用乙酸铵/乙醇沉淀法纯化。
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MacroArray(包括尼龙膜基质和塑料基质)提供的基因特异引物混合物(CDS Primer)、同位素标记物和逆转录酶,直接在磁珠上合成同位素标记的cDNA探针,最后从磁珠上洗脱标记好的探针,纯化后即可用于杂交。这个标记试剂盒可以从少至10μg的total RNA中制备适用于Clontech公司各种尼龙膜基质和塑料基质MacroArray的高质量cDNA探针。由于将mRNA纯化和cDNA探针合成、标记合为一体,方便用户的同时还可节约成本。这个系统不适用于玻片芯片的探针标记。 4) Clontech公司
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