(metagenome);也称微生物microbial environmental genome, 或)。是由Handelsman等1998年提出的新名词,其定义为“the genomes of the total microbiota found in nature” , 即中全部遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因组,目前主要指环境样品中的细菌和古菌的基因组总和。而所谓(或元基因组学,metagenomics)就是一种以环境样品中的微生物群体为研究对象,以筛选和/或分析为研究手段,以微生物多样性、、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法。 随着二代测序平台例如Roche 454焦磷酸测序仪、ABI公司的SOLID测序仪、Illumina的MiSeq、HiSeq测序仪应用,带来的测序通量上的大幅提高,加上测序成本的降低使得宏基因组技术应用范围、开展规模得到大幅度的提高,例如Sorcerer II全球海洋采样计划(The Sorcerer II Global Ocean Sampling project, GOS)的开展。对于低丰富度物种组成的生境(如酸性矿山废水生物膜)进行大规模测序,使得群落中优势物种基因组的重建成为可能,同时基于极端生境中主要代谢网络的构建对于微生物生存机制也有所了解。 技术参数