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安捷伦
Alissa Align & Call为从原始数据到报告起草的整个过程提供生物信息学的准确度和速度。借助由 Agilent SureSelect、HaloPlex 和 OneSeq 文库和试剂共同创建的样品优化算法,Align & Call 可以解锁复杂的数据并加快获得结果的速度。在 NGS一体化工作流程中,Align & Call 的上游流程可以比对和识别变异以进行检测、注释和可视化,具有可扩展性,然后其 QC 评估和 VCF 文件可以轻松进入下游流程并在 Alissa 平台进行数据解析和报告。使用 Align & Call 的分析流程浏览从原始数据到变异识别的大型基因组数据,不需要复杂的 IT 架构或特殊硬件。Align & Call 作为完全托管的工作流程,可以轻松部署,而且安捷伦专家团队可以帮助您的实验室进行快速设置和扩展规模。Alissa Align & Call 将 Alissa 临床信息学平台上的变异评估和报告模块与下游无缝集成,使同一工作组内的所有用户能够轻松导出并浏览 QC 报告和 VCF 文件(需要所有账户全部订阅)。Align & Call 综合 QC 指标可确保 NGS 数据质量达到稳定工作流程的水平。Align & Call 的质量性能主要根据安捷伦的靶向序列捕获解决方案进行优化的算法,能够生成稳定的 SNP、插入和缺失、CNV 和 cnLOH 变异分析覆盖率指标,从而在不影响质量或准确度的前提下提高分析速度。
Alissa Interpret 使临床研究实验室能够高效分类、优化和报告基因组变异。无论数据来自 NGS 还是微阵列芯片,从变异的过滤和注释到优化和分类再到起草实验报告,该基因组数据管理解决方案可以让实验室的工作流程实现全面自动化。依靠专家团队可迅速部署新的检测方法,并随着您实验室研究规模的扩大提高您的研究水平。Alissa Interpret 基于临床研究实验室应用环境开发而成。该软件提供对大量注
释来源和数据库的访问,支持建立定制优化变异数据库,并为遗传模式、表型背景和变异影响检验提供各种深入的分析工具。Alissa Interpret 将CNV、SNP、插入和缺失以及融合基因结合到一个一体化的工作流程中。Alissa 将您的应用工作流程加以整合,从体细胞到遗传性疾病、从分子变异到结构变异,以及从二级数据分析到三级数据分析 ― 所有这些均可在单一平台上完成。
Alissa Interpret 提供
- 遗传性疾病样品和体细胞变异样品工作流程
- 分子变异和结构变异的分类和优化
- 实施临床级标准操作规程 (SOP)
- 轻松访问数据库并起草实验报告
- 与专家团队共同合作
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文献和实验肿瘤样本来源; 4、建立和维持的成本较高; 5、需要配备相关的技术平台,如生物信息学平台、高通量检测平台等。 CDX模型的缺点 1、在培养和传代过程中进行了“筛选”; 2、肿瘤细胞逐渐适应体外培养环境而失去原有特性; 3、缺乏肿瘤生长的相关环境,如:支持性的非肿瘤基质、血液细胞、其他肿瘤微环境因子; 4、缺乏肿瘤的多样性和异质性、模型与临床病人缺乏相关性。 PDX与CDX比较 CDX PDX 患者自身肿瘤
1 个碱基对测序的价格在 1 美元,全基因组测下来 30 亿美元。而如今,基因组已经进入了千元时代,人人都可以想做就做,因而产生了大量的有待分析数据。 二、生物信息学的基本功能 了解了什么是生物信息学,下一步就是要知道怎么利用它来解决实际问题,包括指导基础实验方向或结合临床数据解决实际问题等。 这里就回到一开始的问题: 「用生信手段辅助自己课题进展,一定要会写代码,会复杂的 R 语言并掌握大量的数学、统计知识才能开始吗?」答案是否定的。 上面提到的知识都懂当然最好,但作为一个临床医生或医学生,显然
生命价值……」 中国人需要自己的基因测序平台 谈起基因测序仪,盛博士说:「它不仅仅是一台仪器更是一整套平台。我们以『HYK-PSTAR-IIA 基因测序仪』为核心的测序平台研发进程与国际同步,这也使得我们成为目前全球高通量基因测序平台真正商业化的三家公司中的一家,其他两家是美国公司。」 他解释说:「基因测序是精准医疗核心关键技术,而测序平台是整个测序技术在国内多年发展过程中比较困难的地方。从样本的提取、保存、制库,到上机测序、数据计算、质量分析、生物信息学






