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- 2025年07月13日
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大量
- 英文名：
Ribo-off rRNA Depletion Kit (Bacteria)
- 供应商：
上海信裕生物科技有限公司
- 规格：
12 rxn/24 rxn
以上表格为1 μg不同的细菌Total RNA同时用Ribo-offTM rRNA Depletion Kit (Bacteria)（Vazyme #N407）和Ribo-Zero rRNA Removal Kit (Bacteria) （Illumina，MRZB12424）去除rRNA，并用Total RNA-seq (H/M/R) Library Prep Kit（Vazyme #NR603）进行后续的文库构建，可以看出N407有优异的rRNA去除效率。
Ribo-offTM rRNA Depletion Kit (Bacteria)是针对革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA中去除rRNA的试剂盒。本试剂盒适用于起始量模板为1-5 μg的革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌总RNA，总RNA样本经过rRNA与探针杂交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步骤，最终将rRNA（包括16 S和23 S rRNA）从总RNA中去除，保留mRNA和其它非编码RNA，可用于LncRNA等非编码RNA的分析；该试剂盒同时适用于完整的和部分降解的RNA样本(例如FFPE RNA)，所得的产物适用于RNA文库及其他实验。
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文献和实验与磁珠表面上修饰的Oligo(dT) 分子杂交。杂交后，除去无聚腺苷酸化的RNA。磁珠清洗，然后通过提高温度实现mRNA的洗脱（图 2）。 图1 | poly(A) RNA 分选示意图。该工作流程改编自Lexogen 的 Poly(A) Selection Kit。 在poly(A)分选的过程中，由于绝大多数的rRNA分子无poly(A)结构，因此可以除去这些 rRNA 分子。通常只会有约 2 – 5% 的reads数mapped到线粒体 rRNA，因为这些线粒体rRNA有 poly(A) 尾
rRNAs (5S rRNA, and additional 5.8S rRNA for eucaryotic RNA), and may also contain regulatory RNA molecules such as microRNA (miRNA) and short interfering RNA (siRNA), snRNA, and other RNA transcripts of yet unknown function. The RiboMinus™ RNA
，所以我必须除掉他们！ 若是有足够多的total long RNA，可以分两步来做：一先先从total long RNA中提取Poly A+ RNA，二再用ribo Minus kit除去仍然残留的rRNA；若是没有足够多的total long RNA，就直接用ribo Minus kit除去rRNA。 Qiagen和Invitrogen都有kit来提取Poly A+ RNA，效果感觉差不多，不过好像有的人更喜欢Invitrogen的，Qiagen的要相对便宜点（单价贵，但是能够处理
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