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935K人甲基化芯片
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Canine HD Genotyping BeadChip
晶能生物
EPICv2.0-935K芯片可检测人全基因组约935,000个CpG位点的甲基化状态,在EPICv1.0-850K的基础上去除了性能不佳的探针,新增186,000个CpG位点,包括靶向增强子和超级增强子、更多CTCF结合位点、CNV检测区域、EPIC v1.0覆盖不足的CpG岛以及常见癌症驱动突变,可广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他复杂疾病研究,适合于表观基因组全关联分析研究(EWAS)。技术原理样本要求• 样品总量:每个样品DNA总量不少于1000ng• 样品浓度:最低DNA浓度不低于10ng/ul• 样品质量:电泳图中DNA必须有一条大于10kb的主带,且无降解(主带下无明显弥散带),无蛋白或RNA等污染• 样品运输:DNA样品低温运输(-20℃)技术特点
•全面的基因组覆盖范围:检测>935,000个CpG位点,全面覆盖CpG岛、启动子、编码区以及增强子。• 高质量的数据:沿用450k 850k的infifinium技术,同时采用I和II类探针设计,使检测范围最大化。• 分辨率高:单碱基分辨率,可以直接检测到发生甲基化的准确位点。• 可重复性高:自身技术重复间的相关性以及于850k相同探针间的相关性R2>0.98适用于FFPE样本应用领域表观基因组关联分析(EWAS分析):探究表观遗传学层面上复杂疾病的致病原因。基础科研调控机制研究:遗传印记、胚胎发育、肿瘤和疾病的发生、发展临床应用:辅助病例诊断,潜在标志物
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