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文献和实验的DNA芯片公司,已使用制造计算机半导体芯片相同的技术。他们使用光敏掩膜和光来选择性的在硅板上显露反应位点,然后附上核酸。因为核酸由A,T,C和G组成,需要四套掩膜和四次反应。现在可购得的 affiy芯片包含25个核酸,这需要100个掩膜和反应。一种新的芯片布满光活性罩,当光选择性的通过掩膜时,反应物基团被暴露于光线之下然后与下面的个体反应。 Affimetrix正在生产酵母,人,小鼠和其他的DNA芯片, 而且这些被用于一次测量所有的基因表达。但是,普通的基因由数以千计的碱基组成,使用只有25个碱基
含量放大100万倍,只需2个多小时的时间。 五、大规模DNA测序的趋势——自动化 DNA测序实现规模化的重要条件是自动化和机械化。目前,DNA制备、克隆文库组建及筛选、DNA测序分析、数据的分析获得、碱基序列阅读、重叠克隆群顺序排定等过程均已平行发展,自动化操作紧随其后。随着DNA测序不断由半自动化向自动化过渡,原始数据积累将不成问题,关键是把全基因的散测序组装起来,以实现DNA测序的完整性。目前,在亚克隆筛选、模板制备、测序反应、碱基阅读等方面均在一定程度上实现了自动化。 1、 克隆
or cosmid DNA of interest into a 12 X 75 mm Falcon tube containing 2 ml of LB media supplemented with the appropriate antibiotic (typically ampicillin at 100 ug/ml) and incubate at 37deg C 8-10 hours with shaking at 250 rpm. Transfer the culture
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