
Hiseq2500二代测序仪
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- 2025年07月15日
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| 技术指标: | 1高数据通量:每次仪器运行单端读取至少可生成300G碱基数据,双端读取至少可生成600G碱基数据;在快速运行模式下27h内产生120G数据
2 实验时间:单端读取4天,双端读取8天(根据测序长度略有变化);
快速模式27h
3运行成本:从样品制备到数据读取,每测量100万个碱基对所需成本不高于0.05美元
4数据读长:单端读取序列,读长大于100个碱基;
5双端读取序列:高通量模式读长2x100个碱基;快速模式读长2x150个碱基
6样品用量:DNA样本需要0.1-1微克gDNA或cDNA
7读取精度:原始数据准确性≥98.5%,3倍覆盖拼接序列准确性≥99.99%
8可精确读取≥10个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAA),准确性≥98.5%
9不同样品并行性:每次仪器运行可平行分析8个非混合的独立样品
10 可开展ChiP-seq、小RNA发现的定量、未知物种测序、转录组研究、甲基化研究试剂盒,宏基因组研究、重测序、目标区域重测序。
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| 使用范围: | Hi-seq2500主要用途:
1.未知物种基因组的从头测序
2.已经测序物种的基因组重新测序
3.基因组尺度转录组学分析(Transcriptomics)
4.基因表达谱及基因调控研究
5.全基因组小分子RNA(miRNA)分析
6.染色质免疫互沉淀研究(ChIP)
7.多重单核苷酸多型性(SNP)分析
8.甲基化研究
9. 其他表观遗传学研究如磷酸化修饰
10.蛋白-DNA相互作用研究
11. 染色体重排研究(缺失,插入等等)
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文献和实验干货 | CUT and Tag 让 ChIP-Seq更简单高效!
&Tag 技术的实验流程简单,可一步实现 DNA 的片段化和接头连接,仅需 9h 即可实现从细胞到二代测序文库的转化。 实验流程主要包括:①收集细胞;②分别孵育一抗和二抗;③孵育 pA/pG-Tn5 转座子(Hyperactive pA/pG-Tn5 Transposon);④激活转座子,进行 DNA 片段化;⑤DNA 提取;⑥文库扩增与纯化。 1. 细胞起始量低 投入不同起始量的 HEK293 细胞( 100 或 10,000 个细胞),按照 Vazyme #TD901
接头,可直接进行 PCR 扩增得到 CUT&Tag 文库。 10.对于 CUT&Tag 的实验样本,二代测序上机应该如何选择 ?测序公司反馈文库有大片段分布怎么处理?需要做文库分选吗? 使用常规的 PE150 即可,主流的测序平台如 HiSeq X10 以及 Novaseq 均可。CUT&Tag 文库分布会有一定的大片段,组蛋白修饰呈现典型的梯子状或做转录因子经过了 qPCR 验证有富集,可以选择风险上机。不需要做文库分选,数据产生方面会有些波动。 文章
【medical-news】1000美元就可以完成全基因组测序?
, said that it will release its own genome-in-a-day contender, the HiSeq 2500, in the second half of this year. Unlike Life Technologies, which is asking customers to buy an entirely new machine, Illumina says that it will be able to upgrade existing
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