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上海一基实业有限公司
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文献和实验作为一本基因组学杂志,基因组测序是我们的面包和黄油,我们已经在作物中进行了一些大规模的基因组测序研究。林增和同事看了开心果。他们对93个不同开心果品种和49个野生树种(包括一些来自不同开心果品种)的基因组进行了测序。通过比较这些基因组,他们能够将该物种的驯化日期定在大约8000年前,并且发现,也许不奇怪的是,农民选择了种子较大的树木。王金宇和他的同事进行了类似的研究,比较大豆和玉米的驯化。对于每一种作物,作者比较了野生和栽培植物的基因组。有趣的是,驯化导致两种作物的基因组发生了相似的变化
Methods》10月刊上,哈佛大学的研究人员发表文章称,作为一种RNA导向的dsDNA结合蛋白,Cas9效应物核酸酶是目前已知的第一个统一因子(unifying factor),能够共定位RNA、DNA和蛋白,从而拥有巨大的改造潜力。1 在他们看来,这种工具有望扩展,在复杂的表观基因组上引入定制变化。 两个研究小组最近也利用更为成熟的TALE来修饰表观基因组。霍华德?休斯医学研究所的Bradley Bernstein及其同事就利用去甲基化酶/去乙酰化酶复合物来靶定增强子中的组蛋白标记,以探索
,但TALE的定位比CRISPR/Cas9系统更为繁琐。将Cas9与任何选定的酶相融合,我们不仅可改变组蛋白修饰,从而改变染色质状态,还能影响DNA甲基化,实现全新的细胞功能调控。 然而,CRISPR/Cas9系统的特异性仍存在问题。向导RNA序列比ZFN或TALEN所靶定的大部分序列更短,这意味着脱靶效应的几率更高。近期发表的一些文章也证明了脱靶效应是真实存在的。 《Nature Methods》编辑Nicole Rusk认为,CRISPR是否能被精心打造成编辑表观基因组的手术
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