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赫澎(上海)生物
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文献和实验本人新手,刚接触到microRNA这一领域时,不知道如何下手。通过查阅相关文献,虽然对其有所了解,但也存在诸多困惑!且不说对各种miRNA的功能及作用机制知之甚少,单从最基本的miRNA的命名上看就很是费解,比如:hsa-miR-4720-3p 等应该如何理解呢?我想大多数刚接触到这方面的朋友们估计也跟我有一样的困惑吧?!通过收集各方面的资源,总算有了些收获,为以后在该领域的进一步研究打下了基础。在此分享给大家,希望对各位有所帮助!!! 一、miRNA的定义 miRNA
的相关性;4. Survival Signature Analysis:生存分析;5. Clustering Analysis:聚类分析。1、根据 miRNA 进行搜索1)Tumor Development:查询某条 miRNA 在肿瘤组和对照组是否表达异常:以案例的 miRNA hsa-miR- 92a- 3p 为例,单击 Retrieve cancer types:结果显示 hsa-miR- 92a- 3p 在 14 个肿瘤里面显著表达异常。2)Tumor Stage and Grade
一般情况,我们从文献上看到一条 miRNA,它名称一般是这样的:miR- 21、let- 7 等等。但很多的时候,我们看到的 miRNAs 是这样的:rno-miR- 9 *1、首先,miRNA 命名先确定物种名称,如人种的为 hsa,然后加上 miRNA 的简写 miR/mir,最后加上其被发现的顺序,如上述的 hsa-miR- 217。2、在确定命名规则之前发现的 miRNA,则保留原来的名字,如 hsa-let- 7。3、有一类同源的 miRNAs,它们可能只有 1 - 2 个碱基的差别
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