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上海晶抗生物工程有限公司
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760-93-0
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文献和实验2.2.10 DNA微阵列法 Yan等2001年[40]将以分子杂交为基础的微阵列技术应用于DNA甲基化检测中,这种方法是基于杂交的寡核苷酸微阵列,是一种在基因组中寻找新位点的方法。包括用于整个基因组范围内扫描的差异甲基化(DMH)杂交(Huang等1999年[41])和用于检测某个位点的甲基化特异性微阵列MSO(Gitan等2002年[42])。前者类似于mRNA表达谱或cDNA微阵列,是CpG岛微阵列,后者类似于寡核苷酸微阵列,是针对CpG二核苷酸位点的甲基化特异性寡核苷酸微阵列[26
聚集成 CpG 岛(CCIs),50% 以上的基因启动子都含 CCIs,一般都集中在转录起始位点。甲基的存在导致了转录过程终止,从而使这些基因沉默。其机制主要与转录因子 CTCF(CCCTC binding factor)蛋白和甲基 CpG 结合蛋白(MBP)有关。CTCF 可以控制染色质三维结构的改变,促进或抑制不同位点的基因表达,但 CTCF 不能与甲基化CpG 结合,MBP 含有甲基化 CpGs 结合域,同时能与组蛋白去乙酰化酶(HDAC)结合,可重构染色质并抑制转录。 图
,CpG岛中的CpG位点通常是处于非甲基化状态,而在CpG岛外的CpG位点则通常是甲基化的。这种甲基化的形式在细胞分裂的过程中能够稳定的保留[8]。当肿瘤发生时,抑癌基因CpG岛以外的CpG序列非甲基化程度增加,而CpG岛中的CpG则呈高度甲基化状态,以致于染色体螺旋程度增加及抑癌基因表达的丢失[9]。1.2 DNA甲基化的生物学作用1.2.1 DNA甲基化与遗传印记、胚胎发育DNA甲基化在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育过程中起着极其重要的作用。研究表明胚胎的正常发育得益于基因组DNA适当的甲基
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