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文献和实验【转帖】一种快速,灵敏的,经济的测序方法--焦磷酸测序 介绍
首先通过PCR制备待测序的DNA模板,PCR的引物之一是用生物素标记的。PCR产物和偶连avidin的Sepharose微珠孵育,DNA双链经碱变性分开;纯化得到含生物素标记引物的待测序单链,并和测序引物结合成杂交体。 Pyrosequencing技术是由四种酶催化的同一反应体系中的酶级连反应,四种酶是:DNA聚合酶(DNA polymerase)、硫酸化酶(ATP sulfurylase)、荧光素酶(luciferase)和双磷酸酶(apyrase).反应底物为adenosine 5′
聚合酶的作用下,添加到测序引物的3‘末端,同时释放出一个分子的焦磷酸(PPi)。第2步图示(图片来自互联网)第3步:在ATP硫酸化酶的作用下,生成的PPi可以和APS结合形成ATP;在荧光素酶的催化下,生成的ATP又可以和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光。通过CCD光学系统即可获得一个特异的检测峰,峰值的高低则和相匹配的碱基数成正比。第3步图示(图片来自互联网)第4步:反应体系中剩余的dNTP和残留的少量ATP在Apyrase的作用下发生降解。第4步图示(图片来自互联网)第5步:加入另一
Roche 454(GS FLX Titanium System)超高通量测序技术原理
也进一步提升。 GS FLX 测序原理 GS FLX系统的测序原理和GS 20一样,也是一种依靠生物发光进行DNA序列分析的新技术;在DNA聚合酶,ATP硫酸化酶,荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP 的聚合与一次荧光信号释放偶联起来 (图 1)。通过检测荧光信号释放的有无和强度,就可以达到实时测定DNA序列的目的。此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针,也不需要进行电泳;具有分析结果 快速、准确、灵敏度高和自动化的特点。 Roche GS FLX
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