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Active Motif
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12 rxns
Active Motif 提供 ChIP 实验完整解决方案
Active Motif 简介:
Active Motif公司是一家致力于研发和生产核细分子生物学和表观遗传学研究用试剂的专业公司,也是世界著名的转录因子试剂生产商和CHIP-seq外包服务供应商。
Active Motif的产品涉及:表观遗传学相关抗体、Chip级别抗体、重组识别子和催化酶、预甲基化修饰的重组组蛋白、多聚核小体和生物素标记核小体;以及各类染色质分析、转录因子表达调控分析和DNA甲基化分析的试剂盒等。
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文献和实验染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种用于研究目的蛋白在染色质上定位的技术。ChIP 的原理是通过甲醛处理细胞固定 DNA 和蛋白,然后提取染色质,使用超声或酶解将染色质剪切成小片段。 之后使用结合在染色质的目的蛋白或组蛋白修饰特异性抗体富集 DNA 片段。富集的 DNA 片段可以通过 PCR,DNA 芯片或测序进行分析。虽然原理看起来很简单,但 ChIP 是一项非常具有挑战的技术,很多因素都可能导致实验
做 ChIP(Chromatin Immunoprecipitation)已经几个月了,虽时间不长,但深刻体会细节决定成败,这里就把自己认为值得注意的细节总结如下: 1、cell counting:尽量做到准确,会影响 input 结果。 2、cross link:甲醛的终浓度是 1%,这个基本所有的 protocol 上都会强调。 3、resuspend cells with SDS:一定要选用小的 tip 头,在液面下吹打,否则很容易产生气泡,后面的 sonication 就麻烦
糖凝胶上检测分析。如图一所示 图一:2.2 超声破碎后,8000g,30秒,4°C,离心。将上清移入新的管子中。开始准备进行染色质免疫共沉淀(IP)。2.3 每份超声样品取50ul,这时的样品标记为INPUT,用于定量DNA浓度和作为PCR的空白对照。超声后的染色质应立刻冻入液氮中或者储存于-70°C可储存2个月。避免多次反复冻融。3检测DNA浓度1INPUT样品用于为后来的IP样品计算DNA浓度。DNA可采用PCR纯化试剂盒(加入70ul洗脱液,接着进入3.2a)或者采用酚/氯仿抽提(加入350ul
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