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分子生物学技术
真核细胞DNA的制备与定量|质粒DNA的碱裂解法提取与纯化|λ噬菌体DNA提取|DNA分子的限制性 内切酶消化|DNA片段回收与纯化|目的基因的亚克隆|PCR|引物参数计算|PCR产物的克隆|DNA序列测 定|Southern 杂交|PCR-SSCP|细胞凋亡|RNA操作中的一般要求|RNA的制备|mRNA的分离与纯化|RT-PCR|Northern Blot|RPA|ddPCR|原位杂交|原核表达|蛋白SDS电泳|Western|表达蛋白的分离与纯化|表达 蛋白的生物学活性的检测|真核转染
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文献和实验。) 使用不同的聚合酶 通常用于体外转录的三种 RNA 聚合酶可以相互不同地转录给定的模板。当转录不能完成时,可以充分利用这种转录给定模板序列的不同能力。改变转录模板前面的聚合酶启动子序列是一种劳动密集型修复,因为它可能需要设计 PCR 引物或亚克隆。Ambion 具有可简化过程的载体和引物。pTRIPLEscript 系列载体具有串联排列的 SP6、T7 和 T3 启动子,这些载体特别适用于亚克隆转录模板。或者,Ambion 的无克隆启动子添加试剂盒 Lig'nScribe 可用于改变可 PCR 扩增
在哺乳动物细胞中进行RNA干扰:设计,实验和分析siRNA效应
, COS7, 293, NIH/3T3, A549, HT-29, CHO-KI, 和 MCF-7,选择同源序列部分最有效的siRNA,分别转染这8个细胞株。用Northern分析GAPDH和两个负对照(cyclophilin 和 28S rRNA)mRNA。结果显示,GAPDH siRNA对所有细胞株都表现出某种程度的基因沉默效果,说明基因沉默通路在多种哺乳动物细胞中是普遍存在的。 图二:不同哺乳动物细胞对siRNA诱导的基因沉默的易感性。 如图所示的细胞株分别用化学合成和体外转录
注意RNAse的防污染操作。 制备RNA探针的常用方法是构建含探针标记模板的重组质粒,将克隆子的转录区下游进行限制性酶切线性化后,进行体外转录的探针合成反应。当然,采用的质粒上必须含有SP6,T3或T7 RNA聚合酶的启动子序列。体外转录法合成的探针量很大,通常情况下,1μg的DNA模板进行反应,将得到20μg的标记RNA探针。 另一种更加直接的体外转录标记法,是先通过PCR方法制备DNA探针模板。扩增引物需要特殊设计,包含SP6,T3或T7 RNA聚合酶的启动
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