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- illumina 850K/450K DNA甲基化芯片
- 2025年07月16日
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- 服务名称：
illumina 850K/450K DNA甲基化芯片
- 提供商：
鼎赛基因
一、芯片特点：
1.覆盖全面：检测853,307个CpG位点；全面覆盖CpG岛、启动子、编码区及增强子以及人类肝细胞中的非CpG甲基化位点、肿瘤（多种类型的癌症）VS正常样本中的不同甲基化位点、FANTOM5增强子、ENCODE开放染色质和增强子、脱氧核糖核酸酶超敏位点、miRNA启动子区域、涵盖Infinium Methylation 450 BeadChip芯片中的＞90%的内容。
2.亚硫酸氢盐处理基因组DNA即可进行芯片实验；
3.相较于MeDIP-seq的定位区段而言，850K芯片直接识别甲基化位点；
4.技术重复重现率>98%；
5.操作简单，无须PCR扩增；模板量可低至250ng；
6.除组织细胞血液等常规类型样品外，还适用于FFPE样品。
三、实验流程：
四、样品要求：
类型：组织、细胞、血液、石蜡包埋组织等样本基因组DNA
纯度：OD 260/280值应在1.7～2.0 之间；无RNA残留。
浓度：浓度不低于50ng/μl，且溶解在TE中；
总量：每个样品总量不少于5μg 。
运输：-20℃运输。
五、分析内容：
基础分析：
高级分析：
差异甲基化位点在染色体上分布：
chayijiaji差异甲基化位点聚类图：
天津鼎赛生物基因科技有限公司
地址：天津市和平区南京路239号瑞竹大厦B座604室
电话：022-58650126
网址：www.dingscience.com
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文献和实验甲基化芯片背景甲基化芯片原理：https://www.jianshu.com/p/c4f758e0399d芯片主要分为 EPIC 和 450k 两种，EIPC 也就是 850k，两种探针的都是以 cg 开头的数字编号，所谓注释也就是提取这些探针的所对应的信息，例如，探针序列的 CpG 位置信息，对应的基因信息，染色体上的位置信息等等。很多包在安装的时候都会自动下载这些注释信息，并包装在一起，如果我们想要自己注释这些探针，就要考虑如何获取独立的注释信息。而所需要注释数据的，大部分都来自于两个
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近年来涌现出不少DNA甲基化的检测技术，少说也有十几种。大致可以分为两类：特异位点的甲基化检测和全基因组的甲基化分析，后者也称为甲基化图谱分析(methylation profiling)。下面大家介绍一些常用的方法。 一、特异位点的甲基化检测 1. 甲基化特异性PCR(MS-PCR) 这种方法经济实用，无需特殊仪器，因此是目前应用最为广泛的方法。在亚硫酸氢盐处理后，即可开展MS-PCR。在传统的MSP方法中，通常设计两对
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