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- Aksomics(原康成生物)基于新一代高通量测序平台,为您提供一站式RNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,本公司的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。
- 2025年07月15日
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RNA测序技术服务
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康成生物丨数谱生物
| Aksomics(原康成生物)基于新一代高通量测序平台,为您提供一站式RNA测序技术服务,您只需要提供保存完好的组织或细胞标本,Aksomics的技术服务人员就可为您完成全部实验操作,包括RNA抽提、rRNA去除、文库构建、高通量测序和数据分析、并提供完整的实验报告。 |
RNA-seq技术服务特色
1. 采用rRNA去除方法富集,检测更为全面
采用去rRNA的方法进行RNA富集,同时保留带PolyA尾和不带PolyA尾的RNA,为您的研究提供全面可靠的数据。
2. 可采用降解的RNA进行实验,特别适用于临床样品(如FFPE样品)的检测
康成生物采用的去rRNA试剂盒能够有效的去除降解的rRNA,对功能性的RNA分子进行有效的富集, 特别适用于临床样品的检测。
3. 链特异性文库构建
采用的链特异性文库构建方法,可以有效区分正义链和反义链,帮助您同时获得准确的正义链和反义链RNA的表达信息。
*图释:Aksomics采用链特异性的建库方法,可以有效区分正义转录本和反义转录本。
4. 均匀覆盖转录本,5’和3’端偏好性低
采用基于dUTP的建库方案,Reads均匀覆盖转录本,测序结果更可靠。
RNA-seq数据结果展示
1. 基因集富集分析 (GSEA):利用一列(排序的)基因进行基因集富集分析,能够揭示这些基因在不同基因集间的富集情况。
2. 网络分析:通过GO富集分析挑选感兴趣的GO term,对其中的基因构建基因网络图。
3. RNA-Seq和ChIP-Seq整合分析:通过整合RNA-Seq结果和ChIP-Seq富集峰,能够更直观地了解基因启动子区的特征。
康成生物丨数谱生物
地址:上海市闵行区陈行公路2168号浦江智慧10C栋
免费热线:400-886-5058;800-820-5058
电话:021-64451989
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www.aksomics.com
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文献和实验肝细胞癌(HCC)是肝癌的主要组织学亚型,占原发性肝癌的 90%,是全世界癌症相关死亡率的第三大常见原因。肝癌的诱因诸多,譬如遗传、表观遗传改变、慢性乙型肝炎、肥胖和糖尿病等都是肝癌的主要危险因素,而且肝癌预后差,复发率和转移率高。因此本篇应用单细胞测序技术研究案例分享以孙倍成教授带领其研究团队发表在国际免疫学顶级期刊 Immunity 上的肝癌(HCC)炎癌转化调控新机制说起! 1.文章介绍 论著题目:The zinc finger protein Miz1 suppresses liver
2003年,Ma等人开发了PEAKS。PEAKS是用于解析肽图谱的一种串联质谱蛋白质组学软件,可用于基于串联质谱的肽测序,蛋白质鉴定和蛋白质定量分析。他们在PEAKS方法中运用了新的从头测序模型和算法,分为四个步骤: 第一步将图谱进行预处理,包括图谱噪声过滤和图谱峰聚合; 第二步是在简化后的图谱中根据母离子质量列举出所有可能的候选肽段; 第三步和第四步为综合打分的差异分析以及分值正则化。 PEAKS蛋白质从头测序技术一般通过肽从头测序辅助的数据库搜索来进行肽鉴定。同时,它还通过基于肽序列标签
和纯度必须经过琼脂糖凝胶电泳或荧光法测定, 样品应与已知量DNA一起电泳。 (2) 分光光度法对于很多DNA提取物包括质粒小量制备来说,并不能给出一个可信的DNA浓度估计,混杂的染色体DNA、蛋白、RNA、有机物及无机化合物均可能有260 nm光吸收。因此,分光光度法常常错误地高估DNA浓度。 (3) DNA制备过程中用核糖核酸酶处理所产生核糖核苷酸,虽然它们在电泳后DNA样品的前面,并不能观察到,但它们仍会有260nm光吸收。 (一)测序反应: 1. 对于每组测序
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