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- 宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过宏基因组测序，能够解释微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系，极大地扩展了微生物学研究范围。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rDNA高变区/ITS 的PCR扩增产物进行高通量测序，分析该环境下微生物群落的多样性和分布规律。
- 2025年07月16日
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- 服务名称：
环境微生物多样性分析服务
- 提供商：
杭州晶佰生物技术有限公司
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.OTU列表生成及注释
3.基于物种丰度分析：
稀释曲线
Alpha多样性分析
物种丰度差异分析
聚类分析（热图）
多元统计分析（根据实验设计）
单样品物种分布
多样品物种分布
含进化关系的物种分布
Beta多样性分析（PCoA、NMDS）
5.根据客户需求进行个性化分析
样本条件：
1、 样品采集：由于环境条件的变化对微生物影响很大，因此要求样品采集条件保持高度一致。为了防止微生物死亡或DNA降解，采样后立即冷冻保存。
2、 样品DNA：环境因素异常复杂，许多物质或抑制因子会影响后续PCR、测序文库构建和序列测定，常规提取方法不一定合适，建议按公司要求采用专用试剂盒提取。基因组DNA浓度＞50 ng/μl，总量＞5 μg，OD 260/280在1.8-2.0之间，并确保电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整；基因组DNA完全无降解；提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。
3、 样品保存期间切忌反复冻融。
4、 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。
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文献和实验环境核酸是生物与环境互作遗留的核酸，来源包括生物脱落的组织、分泌物、排泄物、血液或尸体等，分布在各种水体、土壤、沉积物或空气等环境中，是微生物和脱落DNA的混合物,这两类核酸在上述环境样本中存在较少。
微生物对人类的好处，除了制造食物和生产有用的物质外，环境中的微生物，其实是地球上所有生物所构成的食物链中极重要的一环。若不是微生物所扮演的分解者，忠心地把死亡的生物体不断分解成活生物体成长所需的营养物质，地球上的生物很快就会面临食物短缺而停止繁衍。此外，人类所制造的垃圾和各类毒性物质对环境造成的污染，如果不是靠着微生物的分解，对人类的危害将不只是现今的千百倍而已。
marcescens）的斜面菌种；其它自选的微生物材料，包括实验室已有的和自己从环境中分离得到的均可。 2、培养基：原则上可以参考以下培养基：完全培养基、缺C培养基、缺N培养基、缺P培养基、缺K培养基、缺Zn培养基、葡萄糖牛肉膏蛋白胨琼脂培养基（含琼脂10g/L，每管12 mL）、牛肉膏蛋白胨琼脂斜面培养基、牛肉膏蛋白胨培养液、牛肉膏蛋白胨琼脂培养基；也可以自己选定其它合适的培养基。 3、试剂： 0.2mol/L K2HPO4、0.2mol/L硼酸、0.2mol/L NaOH、0.1mol/L柠檬酸；1g
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