DAP-seq（DNA亲和纯化测序）技术服务

 

果实成熟伴随着颜色、质地和风味的显著变化，并且由转录因子（TFs）和表观遗传因素调控。然而，详细的调控机制仍然不清楚。基因表达模式表明，PpNAC1（NAM/ATAF1/2/CUC）转录因子在桃子（Prunuspersica）果实成熟中扮演主要角色。DNA 亲和纯化 DAP-seq 结合转录激活测试表明，PpNAC1 可以直接激活多个与成熟相关的基因表达，包括参与乙烯生物合成的 ACC 合成酶 1（PpACS1）和 ACC 氧化酶 1（PpACO1）、与细胞壁修饰相关的果胶酯酶 1（PpPME1）、果胶酸酶 1（PpPL1）和多聚半乳糖醛酸酶 1（PpPG1），以及参与挥发性物质合成的脂肪酶1（PpLIP1）、脂肪酸去饱和酶（PpFAD3-1）和醇酰基转移酶 1（PpAAT1）。PpNAC1 在番茄（Solanum lycopersicum）nor（不熟）突变体中的过表达恢复了果实成熟，其在桃子果实中的瞬时过表达诱导了目标基因表达，支持 PpNAC1 在果实成熟中的积极作用。PpNAC1 及其目标基因的转录水平增强与它们启动子 mCG 甲基化水平的降低相关。DNA 甲基化的下降与 DNA 去甲基化酶 1（PpDML1）的转录增加负相关，其启动子被 PpNAC1 识别并激活。研究者提出，PpNAC1 启动子区域的甲基化减少导致随后的 DNA 甲基化水平降低和与成熟相关的基因转录增强。这些结果表明，PpNAC1 和 PpDML1 之间的正反馈在直接调控多个桃子成熟和品质形成所需的基因表达中发挥重要作用。