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999
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联硕生物
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1G

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文献和实验要设立对照。该法可用于多样本、多位点甲基化的检测,样本需要量少,适于临床样本,但存在假阳性问题。 2.2.11 甲基化敏感性斑点分析(methylation sensitive dot blotassay,MS-DBA) G Clément等2005年[43]报道了一种新的方法,能够定量或半定量分析样本中的甲基化水平。这个方法的过程是:先用重亚硫酸盐处理待测DNA片段,随后以非CG区的引物行PCR扩增,将扩增产物变性后转移到尼龙膜上,用3'端DIG标记的含有2个CG(或TG)的双核苷酸探针与DNA
DNA 样品,将未甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。重亚硫酸盐处理不会影响甲基化的胞嘧啶(m5C) 。为了检测甲基化位点,一对引物经设计带有鸟嘌呤(G),可与目标序列中的 m5C 配对;为了检测未甲基化位点,另一对引物带有腺嘌呤(A),可与重亚硫酸盐转化分子中的U配对(随后,与后续 PCR 循环中的胸腺嘧啶(T)配对)。通过引物配对得到的阳性 PCR 扩增结果可用于确定位点的甲基化状态(图 7)。 图 7.甲基化特异性 PCR 第一步,使用重亚硫酸盐处理 DNA 样品,将未甲基化的胞嘧啶转化
的。因此,这种限制性内切酶切割后产生的一定长度DNA片段,具有各种单链末端。这对于克隆基因或克隆DNA片段没有多大用处。 二、甲基化酶 细胞的限制-修饰系统中的修饰作用是由甲基化酶(methylase)来完成的。甲基化酶同限制性内切酶具有完全相同的识别顺序。甲基化酶使识别顺序中的某个碱基发生甲基化,保护DNA不被限制性内切酶切开。 真核生物中目前只发现5-甲基胞嘧啶(M5C)。M5C占整个胞嘧啶中的2~7%(果蝇和某些昆虫例外)。M5C大多以M5CpG的形式存在,不同物种或同一
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