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北京百泰派克生物科技有限公司
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测多肽质谱
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多肽质谱分析技术在现代蛋白zhìzǔxué研究中的应用
多肽质谱分析作为蛋白zhìzǔxué研究的核心技术手段,其原理基于电离多肽分子后通过质量-电荷比(m/z)进行jīngquè测定。该技术通过串联质谱(MS/MS)实现多肽序列解析,结合数据库检索可鉴定dànbáizhì组成及修饰状态。典型工作流程包括:样品前处理(如酶解)、液相色谱分离、电喷雾电离(ESI)或基质辅助激光解吸电离(MALDI),zuì后通过高分辨率质谱仪(如Orbitrap或TOF)检测。现代质谱平台如Q-Exactive系列可实现ppm级质量精度,对复杂生物样本中低丰度多肽的检测灵敏度达amol级别。在翻译后修饰分析中,多肽质谱能jīngquè定位磷酸化、糖基化等修饰位点,误差范围通常小于0.02 Da。定量方面,标记策略(TMT/iTRAQ)与非biāojìdìng量(LFQ)方法的结合,使多肽质谱成为动态dànbáizhì组研究的金标准。具体费用需要根据实验需求和样品情况来确定。
技术方法的核心进展
近年来,多肽质谱在数据非依赖采集(DIA)模式上取得突破,如SWATH-MS技术通过预设m/z窗口实现全扫描覆盖,相比传统数据依赖采集(DDA)将鉴定重现性提升40%以上。离子淌度分离(IMS)的引入进一步增加了分离维度,CCS值(碰撞截面)作为新参数显著提高了同分异构多肽的分辨能力。在数据处理层面,人工智能算法如DeepMass等将肽段鉴定速度提升10倍,同时降低假阳性率至1%以下。值得注意的是,交联质谱(XL-MS)与多肽质谱联用可解析dànbáizhì相互作用界面,空间分辨率达Ångström级。
应用场景的拓展
多肽质谱在临床诊断中已实现从发现到验证的转化,例如通过血清多肽指纹图谱识别早期癌症标志物,其AUC值可达0.9以上。单细胞蛋白zhìzǔxué中,基于nanoLC的微量样本处理技术配合多肽质谱检测,使得单细胞水平dànbáizhì定量成为可能,需注意此时样本损失需控制在5%以内。在合成生物学领域,多肽质谱用于验证人工设计蛋白的正确折叠,通过氢氘交换(HDX-MS)可动态监测dànbáizhì构象变化,时间分辨率达毫秒级。
常见问题:
Q1. 如何解决高丰度蛋白对低丰度多肽信号的抑制效应?
A:可采用预分级策略如高pH反相色谱分离,或使用抗体的亲和耗竭法。zuìxīn开发的磁性纳米颗粒富集技术(如Ti-IMAC)能特异性捕获磷酸化多肽,将低丰度信号增强100-1000倍。
Q2. 质谱数据中MS1同位素峰分布异常可能指示何种问题?
A:这通常反映样品制备缺陷,如尿素残留导致氨基甲酰化(+43 Da),或diǎnyǐxiān胺烷基化不wánquán产生的游离巯基。建议优化变性剂清除步骤,并采用Ellman试剂验证烷基化效率。
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