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- 2025年07月16日
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文献和实验ChIP数据分析：ChIP结果图来PK，谁才是发文的香饽饽？
上下游的reads覆盖深度，红色表示覆盖深度高、目的蛋白结合多。我们在不少文献中都可以看到这张图，既可以完整展示，也可以部分展示。 两组样本（蓝色和橙色）组蛋白修饰H3K27ac分布，同一基因（位点）在一组中修饰程度较高，而在另一组中修饰程度较低。（图片来源：TMPRSS2–ERG fusion co-opts master transcription factors and activates NOTCH signaling in primary prostate cancer）
Mol Cell：浙大王青青团队等合作揭示乳酸化调控 RNA m⁶A 修饰促进肿瘤浸润髓系细胞的免疫抑制功能
-6，IL-10，iNOS 等表达。 作者进一步探究，什么因素驱动了 METTL3 的表达升高。肿瘤细胞倾向选择糖酵解（glycolysis）的代谢方式，导致微环境乳酸积累，乳酸的免疫调控效应近年备受关注，包括促进 TAMs、MDSCs 和 Treg 等免疫抑制细胞功能。2019 年，有研究报道乳酸通过组蛋白乳酸化修饰的方式，调控巨噬细胞的炎症应答 [7]。课题组接下来发现，乳酸一方面以组蛋白 H3K18 乳酸化修饰形式促进 TIMs 中 Mettl3 转录；另一方面，乳酸化修饰能直接
化的平衡失调与肿瘤发生和癌症进展有关。 酶调节 乙酰基被组蛋白乙酰转移酶 (HAT) 添加到组蛋白 H3 和 H4 的赖氨酸残基上，并被去乙酰化酶 (HDAC) 除去。组蛋白乙酰化主要靶向启动子区域，称为启动子局部乙酰化。例如，组蛋白 H3（H3K9ac 和 H3K27ac）上 K9 和 K27 的乙酰化通常与活性基因的增强子和启动子有关。转录基因中也发现了 低水平的整体乙酰化，但其功能尚不清楚。 甲基化 组蛋白 H3 和 H4 的赖氨酸或精氨酸残基被甲基化，对转录有不同的影响。精氨酸甲基
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