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文献和实验Angew. Chem:刘涛 / 罗小舟 / 刘小云团队在组蛋白表观遗传学研究中取得进展
氨基酸以外的吡咯赖氨酸通过遗传编码的方式编码到蛋白中。因此,吡咯赖氨酸成为了古生菌中一种独特存在的共翻译修饰(Co-Translational Modification,CTM)方式。 受到这一修饰方式的启发,文章以酿酒酵母为模式生物,借助基因密码子扩展(Genetic Code Expansion,GCE)技术创造出一种含有 CTM 核小体的酵母菌株,研究人员发现与组蛋白 H3K56 位点巴豆酰化共修饰相比,该菌株中组蛋白 H3K56 位点的乙酰化共修饰能够为酿酒酵母 DNA 损伤修复提供
NCB:张勇 / 高绍荣 / 刘文强合作揭示小鼠早期胚胎发育中潜在的印记控制区域
方法分辨率低且假阳性率高,并且难以预测特定基因组区域是否具有等位基因特异性的调控功能。 2022 年 4 月 28 日,同济大学生命科学与技术学院张勇教授与高绍荣教授课题组合作在 Nature Cell Biology 在线发表了题为 Allele-specific H3K9me3 and DNA methylation co-marked CpG-rich regions serve as potential imprinting control regions in pre
Dev Cell:刘光慧 / 张维绮 / 曲静合作揭示胎盘基因的异常激活是人类细胞衰老的驱动力
衰老的关键驱动力和分子标志物。该研究加深了人们对衰老程序化的认识,同时也为衰老的科学预警、衰老相关疾病的防治提供了潜在的评估策略和干预靶标。 该研究基于团队前期创建的人类干细胞衰老研究体系,综合运用 DamID-seq、Hi-C、ChIP-seq(H3K9me3、H4K20me3、H3K27me3、H3K4me3、H3K36me3、H3K27ac、H3K4me1)、ATAC-seq 和全基因组 DNA 甲基化测序(WGBS)等多维技术系统地绘制了人干细胞衰老过程中跨尺度、多层次、高分辨率的表观
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