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文献和实验Cancer Cell I 多组学连用绘制肝内胆管癌多维分子图谱,助推精准治疗的开发
荧光技术方案对于肿瘤样本组织芯片的蛋白标志物进行了深度分析,将 MPO、POSTN、ALDOB、EPCAM 等蛋白靶标使用多色联合标记并结合患者临床预后数据进行了验证分析,结果表明这些标志物可以对于患者进行良好分层分析,提示可以作为肿瘤早期干预的良好指标。 基于基因学手段研究人员还发现 TP53、KRAS、IDH1/2、BAP1 以及 FGFR2 基因变异是肝内胆管癌中相互独立发生的,深入研究发现 TP53 突变与细胞周期、吞噬行为和代谢通路激活有关,而 KRAS 突变导致炎症感染和粘着相关蛋白上调
Cancer Cell:樊嘉 / 周虎等绘制肝内胆管癌多组学分子特征全景
53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1 等肝内胆管癌主要驱动突变对蛋白质组和磷酸化蛋白质组的影响。研究发现,中国人群样本中特异性存在黄曲霉毒素突变指纹,与高肿瘤突变负荷和高 NK 细胞浸润等显著相关。FGFR2 的融合和突变可能通过激活 Rho GTPase 通路来促进 iCCA 发展,其部分融合蛋白衍生肽具有较强免疫原性,是潜在免疫抗原靶点。 随后,联合团队进一步分析了肝内胆管癌染色质拷贝数变异对 mRNA 及蛋白的顺式和反式调控效应。科研人员根据蛋白质组数据将 iCCA 患者分为炎症
: 1. Prepare Whole Cell Extract. Make sure every solution DOES NOT contain DTT. 2. Add 1 or 2 μl of non-diluted monoclonal antibody (4B4 is better than 10H8 for HSF1) or 1/10 diluted polyclonal antibody to 10 μg of whole cell extract
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