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文献和实验Angew. Chem:刘涛 / 罗小舟 / 刘小云团队在组蛋白表观遗传学研究中取得进展
氨基酸以外的吡咯赖氨酸通过遗传编码的方式编码到蛋白中。因此,吡咯赖氨酸成为了古生菌中一种独特存在的共翻译修饰(Co-Translational Modification,CTM)方式。 受到这一修饰方式的启发,文章以酿酒酵母为模式生物,借助基因密码子扩展(Genetic Code Expansion,GCE)技术创造出一种含有 CTM 核小体的酵母菌株,研究人员发现与组蛋白 H3K56 位点巴豆酰化共修饰相比,该菌株中组蛋白 H3K56 位点的乙酰化共修饰能够为酿酒酵母 DNA 损伤修复提供
化可以促进转 录激活 (Greer et al., 2012),而赖氨酸甲基化则同时涉足转录激活和抑制,具体取决于甲基化位点。这 种灵活性可以解释为甲基化不会改变组蛋白电荷,也不会直接影响组蛋白-DNA 相互作用,与乙酰化不同。 赖氨酸可以单甲基化、双甲基化或三甲基化,从而为每个甲基化位点提供进一步的功能多样性。例如, 组蛋白 H3 K4 (H3K4me1 和 H3K4me3)上的单甲基化和三甲基化都是活化标志物,但是也有着特殊 的细微差别:H3K4me1 通常会标记转录增强子,而 H3
Dev Cell:刘光慧 / 张维绮 / 曲静合作揭示胎盘基因的异常激活是人类细胞衰老的驱动力
衰老的关键驱动力和分子标志物。该研究加深了人们对衰老程序化的认识,同时也为衰老的科学预警、衰老相关疾病的防治提供了潜在的评估策略和干预靶标。 该研究基于团队前期创建的人类干细胞衰老研究体系,综合运用 DamID-seq、Hi-C、ChIP-seq(H3K9me3、H4K20me3、H3K27me3、H3K4me3、H3K36me3、H3K27ac、H3K4me1)、ATAC-seq 和全基因组 DNA 甲基化测序(WGBS)等多维技术系统地绘制了人干细胞衰老过程中跨尺度、多层次、高分辨率的表观
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