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- 2025年07月12日
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文献和实验DNA 如何被压缩成染色体？Science 背靠背研究揭示黏连蛋白参与 DNA 环挤压过程
F. Davidson 等 2 在 science 杂志上背靠背发表两篇文章揭示了在存在 NIPBL-MAU2 蛋白复合物的情况下，人黏连蛋白复合物（human cohesin-NIPBL complex）可以充当分子马达的作用在体外高速挤压 DNA 环。与调节姐妹染色单体内聚的方式不同，黏连蛋白在环挤压过程中不会在拓扑结构上捕获 DNA。这些结果为染色质的环挤压模型提供了直接的证据，并表明基因组结构是高度动态的。图片来源：science研究背景DNA 通过依赖于称为黏连蛋白的环状
亚单位和相关蛋白参与了一系列发育障碍，统称为粘蛋白病。最著名的黏液病是Cornelia-de-Lange综合征（CdLS）。尽管在有丝分裂过程中，黏着蛋白以其将姐妹染色单体结合在一起的作用而闻名，但大多数CdLS患者在基因调控方面表现出改变，而不是有丝分裂缺陷。Bickmore实验室发现NIPBL，一种在S期将黏着蛋白复合物装载到染色质上的蛋白质，可能在调节高阶染色质结构中起作用，与CTCF和黏着蛋白无关。NIPBL基因突变的CdLS患者显示染色质失活，荧光原位杂交可见。直到最近才有CTCF突变的报道
B 细胞内抗体产生新机制！两篇 Nature 重磅揭示染色质环挤压导致 V(D)J 重组和抗体类别转换重组
。同时，为了避免 AID 突变酶引发 CSR 相关的基因组重组，整个实验都在 AID 缺陷型细胞中进行。实验结果如下图所示：GRO-seq 结果显示，添加 anti-CD40 与 IL-4 诱导后的 B 细胞相比于静息 B 细胞在 Cγ1 与 Cε 处发生转录。HTGTS 结果显示，使用 iEμ–Ιμ 与 3′ IgHRR (HS4) 序列分别作为诱饵在诱导后的 B 细胞基因组上与 Cγ1 与 Cε 基因发生互作。而进一步的 ChIP-seq 也显示，黏着蛋白载体 NIPBL 与黏着蛋白亚基 RAD
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