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- 文献和实验
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文献和实验)和近来引进的混合quadrupole飞行时间(Q-TOF)被常规应用于LC-MS/MS或用电喷雾电离(ESI)来生成肽片段离子谱，以便通过搜寻序列数据库进行蛋白质鉴定。使用仪器控制程序来自动选择肽离子进行碰撞诱导的解离(CID)(数据依赖CID)的不断增多是这些MS/MS仪器的一个明显的趋势。 一些新的构造的具有高潜能的质谱仪被引入到蛋白质组学研究中产生深刻影响。两个研究组近来一个MALDI离子源和一个混合Q-TOF耦联了起来[5,6]。Q-TOF提供的质量准确性和敏感性提升了数据库搜寻
紧张素、胰岛素B链和肌红蛋白的测序可用肽链端解酶羧肽酶Y和P进行酶解，然后结合MALDI-TOF MS监测C-端蛋白［4］。亮氨酸/异亮氨酸和赖氨酸/谷氨酰氨分子量相同，无法区分。Ramsey等［5］通过负离子质谱跟踪由亮氨酸和异亮氨酸衍生出的乙内酰苯硫脲的［M-H］-离子，建立了区分肽中亮氨酸和异亮氨酸的方法。亮氨酸衍生物谱图主要显示丙基的丢失，而异亮氨酸衍生物则显示丢失甲基和乙基。Patterson等［6］用羧肽酶Y对22种有不同氨基酸位置、大小、电荷和极性的肽进行C-端水解，显示了该技术的普遍适用
。 图1. 对MS技术获得的3组癌症患者和健康对照组的血清多肽表达谱的无监督分级聚类分析和主成份分析。 (A) 按照标准操作规程制备的健康志愿者和晚期前列腺癌、乳腺癌和膀胱癌患者的血清样本。在自动固相多肽提取和MALDI-TOF MS分析前随机分为4组。质谱图经处理后采用Qcealign script进行匹配，每个样品获得一个包含651 个m/z值（换算后的离子强度）的峰列表。图中数字代表各组中患者和对照组的例数。(B) 采用标准关联作为各癌症组与正常组间二元距离标尺的平均-连锁分级
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